在处理既违反非法占用土地又违反城乡规划的情况时，并没有一个固定的“谁先处理”的顺序，而是需要根据具体情况，由相关部门依据各自职责和法律规定进行协调处理。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
一、相关部门职责与法律依据
自然资源部门（或原国土资源部门）：
- 职责：负责土地资源的规划、管理、保护和监督，对非法占用土地的行为进行查处。
- 法律依据：主要依据《中华人民共和国土地管理法》等相关法律法规。根据该法，非法占用土地的行为，如未经批准或者采取欺骗手段骗取批准，非法占用土地的，由县级以上人民政府自然资源主管部门责令退还非法占用的土地，对违反土地利用总体规划擅自将农用地改为建设用地的，限期拆除在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施，恢复土地原状等。
城乡规划部门（或城市管理部门）：
- 职责：负责城乡规划的制定、实施和监督，对违反城乡规划的行为进行查处。
- 法律依据：主要依据《中华人民共和国城乡规划法》等相关法律法规。根据该法，未取得建设工程规划许可证或者未按照建设工程规划许可证的规定进行建设的，由县级以上地方人民政府城乡规划主管部门责令停止建设；尚可采取改正措施消除对规划实施的影响的，限期改正，处建设工程造价百分之五以上百分之十以下的罚款；无法采取改正措施消除影响的，限期拆除，不能拆除的，没收实物或者违法收入，可以并处建设工程造价百分之十以下的罚款。
二、处理顺序与协调机制
并行处理：
- 在实际工作中，自然资源部门和城乡规划部门可能会同时发现某个项目或行为既违反了土地管理法规，又违反了城乡规划法规。此时，两个部门可以并行开展调查工作，分别依据各自的法律法规进行处理。
协调处理：
- 如果两个部门的处理结果存在冲突或需要协调，可以由上级政府或相关部门进行协调。例如，可以成立联合工作组，共同对违法行为进行调查和处理，确保处理结果的公正性和合理性。
先易后难或先急后缓：
- 在某些情况下，可能会根据违法行为的严重程度、影响范围或处理难度等因素，确定处理的先后顺序。例如，对于严重影响城乡规划或公共利益的违法行为，可能会优先进行处理。
三、法律建议与后果
法律建议：
- 对于既违反非法占用土地又违反城乡规划的行为，建议相关责任人立即停止违法行为，并主动与自然资源部门和城乡规划部门联系，了解具体的处理要求和程序。
- 同时，建议相关责任人咨询专业律师，以便更好地了解自己的法律权利和义务，以及可能面临的法律后果。
法律后果：
- 如果相关责任人拒不停止违法行为或拒不接受处理，可能会面临更严重的法律后果，包括罚款、拆除违法建筑、没收违法所得等。
- 在某些情况下，相关责任人还可能面临刑事责任，如非法占用农用地罪等。
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