结论：在工程签证部分没有结算，但合同内已结算并出具结清证明的情况下，签证部分是否还能要回来，这主要取决于签证部分与合同内已结算部分是否相互独立，以及结清证明的具体表述和范围。以下从不同角度进行分析：
一、签证部分与合同内结算部分相互独立
法律背景：
- 如果工程签证部分与合同内已结算的部分在性质、内容、工程量等方面均相互独立，且结清证明中并未明确包含签证部分的结算，那么签证部分理论上是可以单独进行结算和主张的。
法律建议：
- 您应仔细审查结清证明的具体内容，确认其是否明确涵盖了签证部分的结算。如果未涵盖，您可以收集签证部分的相关证据，如签证单、工程量确认单、现场照片等，以证明签证部分的存在和工程量，进而向对方主张签证部分的结算。
二、结清证明范围不明确或包含签证部分
法律背景：
- 如果结清证明的表述较为模糊，或者从字面意思上可以理解为包含了签证部分的结算，那么对方可能会主张签证部分已经结算完毕，您再主张签证部分可能会面临一定的法律障碍。
法律建议：
- 在这种情况下，您需要仔细分析结清证明的具体表述和上下文，尝试从合同解释、交易习惯、行业惯例等角度来论证结清证明并未包含签证部分的结算。
- 如果无法直接证明，您可以考虑与对方进行协商，寻求双方都能接受的解决方案。如果协商无果，您可能需要通过法律途径来维护自己的权益，如提起诉讼或申请仲裁。
三、签证部分的有效性及举证责任
法律背景：
- 无论签证部分是否与合同内结算部分相互独立，您都需要证明签证部分的有效性，即签证部分是否符合合同约定、是否经过对方确认等。
- 同时，您还需要承担举证责任，即提供充分的证据来证明签证部分的存在和工程量。
法律建议：
- 您应妥善保管签证单、工程量确认单等相关证据，确保这些证据的真实性、合法性和关联性。
- 在主张签证部分结算时，您应积极提供这些证据来支持自己的主张。如果对方对签证部分的有效性或工程量提出异议，您可能需要通过鉴定、评估等方式来进一步证明。
总结与进一步行动建议：
- 您应首先仔细审查结清证明的具体内容，确认其是否明确涵盖了签证部分的结算。
- 如果未涵盖或范围不明确，您应收集签证部分的相关证据，并考虑与对方进行协商或通过法律途径来维护自己的权益。
- 在整个过程中，您应注重证据的收集和保存，以确保自己的主张能够得到有力的支持。
如果您在处理此类问题时遇到任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。