结论：打工早走二分钟扣200元是否合理，需结合具体情况判断，但通常情况下，这种扣款方式可能不合理且违法。
一、从劳动合同和规章制度的角度分析
劳动合同约定：
- 根据《劳动合同法》的相关规定，用人单位与劳动者签订的劳动合同中应当明确约定工作内容、工作地点、工作时间、劳动报酬等条款。
- 如果劳动合同中明确规定了工作时间和迟到早退的处罚措施，且这些措施不违反法律法规的强制性规定，那么用人单位按照合同约定进行扣款可能是合法的。但扣款金额应当合理，不能过分高于实际损失。
规章制度：
- 用人单位有权制定内部规章制度来管理员工，但这些规章制度必须经过民主程序制定，并向劳动者公示或告知。
- 如果规章制度中规定了迟到早退的扣款标准，且该标准不违反法律法规的强制性规定，那么用人单位按照规章制度进行扣款可能是合法的。但同样，扣款金额应当合理。
二、从法律法规的角度分析
扣款限制：
- 根据《工资支付暂行规定》第十六条：“因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。”
- 这意味着，即使劳动者因迟到早退给用人单位造成了经济损失，用人单位也不能随意扣款，扣款金额受到严格限制。早走二分钟通常不会给用人单位造成直接的经济损失，或者即使造成了损失，扣款200元也可能超过了合理范围。
违法扣款的后果：
- 如果用人单位违法扣款，劳动者有权向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，要求用人单位返还违法扣款的金额，并可能获得相应的赔偿。
三、从实际操作的角度分析
扣款合理性：
- 早走二分钟扣200元，这种扣款方式在大多数情况下可能被视为不合理。因为二分钟的时间很短，通常不会对工作造成实质性影响，扣款200元可能过于严厉。
建议措施：
- 如果劳动者遇到这种情况，可以先与用人单位协商，要求用人单位说明扣款的依据和合理性。
- 如果协商无果，劳动者可以向当地的劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
举例说明：假设一个劳动者的月工资为5000元，如果因为早走二分钟被扣款200元，那么扣款比例达到了4%，这明显超过了每月扣除不得超过当月工资20%的限制（即5000元的20%为1000元，但单次扣款200元在比例上虽未超限，但金额上可能不合理，尤其是当这种扣款频繁发生时）。更重要的是，早走二分钟通常不会造成1000元甚至更多的直接经济损失，因此扣款200元可能缺乏合理性。
总结与建议：打工早走二分钟扣200元是否合理，需结合劳动合同、规章制度以及法律法规进行综合判断。在大多数情况下，这种扣款方式可能不合理且违法。如果劳动者遇到这种情况，建议先与用人单位协商，协商无果后再考虑向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。如果有其他劳动纠纷相关的问题，也可以直接向我咨询。