工程完工后，即使总监辞职，结算仍应按照合同约定的程序和方式进行。针对这一问题，我们可以从以下几个方面进行分析：

一. 合同条款的遵循

1. 合同约定：首先，应查阅工程合同，特别是关于工程结算、验收、款项支付等条款。这些条款通常会明确规定结算的流程、所需文件、时间节点以及责任方。根据《合同法》第六十条，当事人应当按照约定全面履行自己的义务。因此，无论是发包方还是承包方，都应严格遵守合同中的结算条款。

二. 结算流程的继续

1. 流程不受个人变动影响：工程结算是一个涉及多方（如发包方、承包方、监理等）的复杂过程，它并不因某个关键人员的离职而中断。即使总监辞职，结算流程仍应继续进行，相关责任应由其继任者或公司其他负责人承担。
2. 文件准备与提交：承包方应按照合同约定，准备完整的结算文件，包括但不限于工程竣工报告、验收单、工程量清单、发票等，并及时提交给发包方或指定的接收方。

三. 沟通与协调

1. 与发包方沟通：在总监辞职的情况下，承包方应主动与发包方沟通，明确结算流程中的具体负责人和联系方式，确保结算文件能够顺利提交和审核。
2. 关注后续进展：承包方应密切关注结算进展，对于发包方提出的任何疑问或要求，应及时响应并提供必要的协助。

四. 法律途径的保障

1. 合同争议解决：如果因总监辞职或其他原因导致结算受阻，承包方可以依据合同中的争议解决条款，通过协商、调解、仲裁或诉讼等方式维护自身权益。根据《合同法》第一百二十八条，当事人可以通过和解或者调解解决合同争议。

综上所述，即使总监辞职，工程结算仍应按照合同约定的程序和方式进行。承包方应严格遵守合同条款，准备完整的结算文件，并与发包方保持密切沟通，确保结算流程顺利进行。如有任何争议或困难，应及时寻求法律途径解决。