结论：员工开公司车出事故且对方负主要责任时，员工社保一般不能由对方承担，但事故造成的其他合理损失可要求对方赔偿。以下为详细分析：
社保费用承担问题
- 社保缴纳义务主体：根据我国相关法律规定，用人单位有义务为员工缴纳社会保险，这是基于劳动关系而产生的法定义务，与交通事故的责任划分并无直接关联。也就是说，无论员工在交通事故中是否承担责任，以及对方在事故中承担何种责任，公司都应当按照法律规定为员工缴纳社保。
- 对方承担责任的范畴：对方在交通事故中承担主要责任，其承担的责任范围主要是针对事故造成的直接损失，如车辆维修费用、人员伤亡的医疗费用、误工费、护理费等合理费用。社保费用并不属于交通事故直接导致的损失范畴，所以不能要求对方承担员工的社保费用。
事故损失赔偿问题
- 可主张的赔偿项目：虽然社保费用不能由对方承担，但如果员工在事故中受到人身伤害，对于因事故产生的医疗费、误工费、护理费、交通费、住宿费、住院伙食补助费、必要的营养费等合理费用，员工可以要求对方按照其在事故中的责任比例进行赔偿。
- 赔偿的依据和程序：员工可以依据交通事故责任认定书，与对方及其保险公司进行协商赔偿事宜。如果协商不成，员工可以通过向法院提起民事诉讼的方式，要求对方承担相应的赔偿责任。在诉讼过程中，需要提供相关的证据，如医疗费用发票、误工证明、护理证明等，以证明自己的损失情况。
建议：如果员工在开公司车出事故后，对于赔偿事宜存在疑问或遇到困难，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供详细的法律建议和指导。