民间借贷中，主债权和抵押权可以分开起诉。以下是对此问题的详细分析：
一、法律背景与依据
在民间借贷关系中，主债权是指借款人向出借人借款所形成的债权，而抵押权则是为担保主债权的实现而设定的权利。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，主债权和抵押权是两个独立的法律关系，但它们之间又存在密切的关联。抵押权作为从权利，其存在和行使通常依赖于主债权的存在。然而，这并不意味着主债权和抵押权必须一同起诉。
二、分开起诉的可行性
法律程序上的独立性：
- 主债权和抵押权在法律程序上具有相对的独立性。出借人可以单独就主债权提起诉讼，要求借款人偿还借款本金及利息。
- 同时，出借人也可以单独就抵押权提起诉讼，要求实现抵押物以优先受偿。
诉讼策略的选择：
- 在某些情况下，出借人可能选择先就主债权提起诉讼，以尽快获得生效判决并申请强制执行。
- 如果借款人无财产可供执行，出借人再就抵押权提起诉讼，以实现抵押物的变现。
- 另一种情况是，出借人可能认为抵押物的价值足以覆盖主债权，因此选择先就抵押权提起诉讼，以快速实现债权。
实际操作中的注意事项：
- 虽然主债权和抵押权可以分开起诉，但出借人在实际操作中需要注意诉讼时效、证据收集等问题。
- 如果出借人先就主债权提起诉讼并获得生效判决，但在执行过程中发现借款人无财产可供执行，此时再就抵押权提起诉讼可能面临抵押物已被其他债权人查封或拍卖的风险。
- 因此，出借人在决定分开起诉时，应充分考虑各种因素，包括借款人的财产状况、抵押物的价值及变现难度等。
三、分开起诉的法律后果
对出借人的影响：
- 分开起诉可能增加出借人的诉讼成本和时间成本。
- 如果出借人先就主债权提起诉讼并获得生效判决，但未能及时就抵押权提起诉讼，可能导致抵押物被其他债权人优先受偿。
对借款人的影响：
- 分开起诉对借款人而言，可能面临多次诉讼和执行的压力。
- 如果借款人无力偿还主债权，且抵押物被出借人实现，借款人可能面临财产损失。
四、建议与策略
综合考虑诉讼策略：
- 出借人在决定是否分开起诉时，应综合考虑诉讼成本、时间成本、借款人的财产状况及抵押物的价值等因素。
- 如果出借人认为分开起诉更有利于实现债权，可以制定相应的诉讼策略。
及时行使权利：
- 出借人应在诉讼时效内及时行使权利，避免因超过诉讼时效而丧失胜诉权。
- 同时，出借人应妥善保管相关证据，以便在诉讼过程中证明自己的主张。
咨询专业律师：
- 虽然我作为石鹏律师已经给出了专业的分析，但在实际操作中，每个案件的具体情况都有所不同。
- 因此，出借人在决定是否分开起诉时，最好咨询专业律师的意见，以便制定更合适的诉讼策略。不过，您现在就可以直接向我咨询相关问题，我会根据您的具体情况给出更详细的建议。
综上所述，民间借贷中主债权和抵押权可以分开起诉，但出借人在实际操作中需要综合考虑各种因素并制定相应的诉讼策略。