合同中约定甲方会根据公司的经济效益和工作能力调整工资水平，这一条款本身并不违法。不过，是否合法还需结合具体情况来分析，以下从不同角度为你详细阐述：
合法情形
调整机制合理且透明：
- 如果合同中的调整机制明确、合理，比如规定了具体的调整条件（如公司年度利润达到一定比例、员工绩效考核达到优秀等）、调整幅度（如不超过一定百分比）以及调整程序（如提前通知员工、与员工协商等），那么这种调整就是合法的。
- 这种情况下，调整工资水平是基于公司的实际经营状况和员工的工作表现，既符合公司的利益，也体现了对员工的公平对待。
符合法律法规和集体合同：
- 调整工资水平不得违反国家法律法规的强制性规定，如最低工资标准、工资支付规定等。
- 如果公司有集体合同，调整工资水平还需符合集体合同的相关约定。
违法情形
调整机制模糊或不合理：
- 如果合同中的调整机制模糊不清，或者调整条件、幅度、程序等不合理，比如随意降低工资、未提前通知员工等，那么这种调整就可能是违法的。
- 这种情况下，员工有权拒绝不合理的工资调整，并可以寻求法律援助来维护自己的合法权益。
违反法律法规或集体合同：
- 如果调整工资水平违反了国家法律法规的强制性规定，或者违反了集体合同的相关约定，那么这种调整就是违法的。
- 例如，如果公司以经济效益不佳为由，擅自将员工的工资降低到最低工资标准以下，这就违反了国家关于最低工资标准的规定。
法律建议
- 审查合同条款：在签订劳动合同时，务必仔细审查合同中关于工资调整的条款，确保其明确、合理且符合法律法规和集体合同的规定。
- 保留证据：如果公司提出调整工资水平，员工应要求公司出具书面通知，并保留好相关证据，以便在发生争议时维护自己的合法权益。
- 寻求法律援助：如果员工认为公司的工资调整行为违法，或者与公司就工资调整问题发生争议，可以寻求法律援助，通过法律途径来维护自己的合法权益。
总结来看，合同中约定甲方会根据公司的经济效益和工作能力调整工资水平，这一条款本身并不违法，但具体是否合法还需结合调整机制是否合理透明、是否符合法律法规和集体合同等因素来判断。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。