公司合同只留一份是不合法的，特别是当这份合同涉及劳动合同关系时。以下从不同角度为您详细分析：
一、劳动合同的份数要求
根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动合同由用人单位与劳动者协商一致，并经双方在劳动合同文本上签字或者盖章生效。劳动合同文本应当由用人单位和劳动者各执一份。这一规定旨在保障劳动者的知情权和合同权益，确保双方都能持有合同文本，以便在需要时查阅和主张自身权益。
二、公司只留一份合同的法律后果
劳动者权益受损：如果公司只保留一份劳动合同，不给劳动者，那么劳动者在查阅合同条款、主张自身权益时可能会受到阻碍。特别是在发生劳动纠纷时，劳动者可能因无法提供劳动合同而难以举证双方约定的权利义务内容，进而在维权过程中陷入被动。
公司可能面临法律责任：根据法律规定，用人单位未将劳动合同文本交付劳动者的，由劳动行政部门责令改正；给劳动者造成损害的，应当承担赔偿责任。因此，公司只留一份合同的行为不仅违反了法律规定，还可能因此承担法律责任。
三、劳动者的应对措施
要求公司提供合同：劳动者有权要求公司提供属于自己的那份劳动合同。如果公司拒绝提供，劳动者可以向劳动监察部门投诉，由劳动监察部门责令公司改正。
收集相关证据：在要求公司提供合同的同时，劳动者应收集与劳动关系相关的其他证据，如工资条、工作证、考勤记录等，以便在发生纠纷时能够证明自己的权益。
寻求法律援助：如果劳动者在维权过程中遇到困难，可以寻求法律援助或咨询专业律师，以获取更专业的法律帮助。
四、其他类型合同的考虑
虽然上述分析主要针对劳动合同，但对于其他类型的合同，如建设工程合同、买卖合同等，一般也建议双方各执一份。这有助于明确双方的权利义务，减少纠纷的发生。如果公司只留一份合同，可能会引发对方对合同真实性和有效性的质疑，进而影响合同的履行和双方的合作关系。
建议您：在签订任何合同时，都应确保双方各执一份合同文本。如果公司只留一份合同，您可以要求公司提供属于您的那份合同，并保留好相关证据以备不时之需。如果您在合同方面遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。