核心结论：行政案件受理后十二年未找到违法行为人，案件可能面临程序上的终止或中止，但具体处理需结合案件性质、法律规定及实际情况综合判断。以下从法律程序、实体处理及实务建议三个角度展开分析：

1. 法律程序角度：诉讼时效与执行期限

• 行政处罚时效：根据《行政处罚法》第三十六条，违法行为在二年内未被发现的，不再给予行政处罚（法律另有规定的除外）。若案件已受理但未找到违法行为人，需核查是否已超过法定处罚时效。若超过，行政机关可能丧失处罚权，案件应依法终止。
• 执行期限：若案件已作出行政处罚决定但未执行（如罚款未缴纳），根据《行政强制法》第五十三条，申请法院强制执行的期限为三年。超过期限的，行政机关可能丧失强制执行权，需通过其他途径（如重新立案）解决。
• 实务提示：若案件未超过时效或执行期限，行政机关可继续调查；若已超过，需评估是否通过补充证据、重新立案等方式延续程序。

2. 实体处理角度：违法行为人的认定与责任

• 违法行为人无法查找的后果：若无法确定违法行为人，行政机关可能因缺乏责任主体而无法作出处罚决定。此时，案件可能因“事实不清、证据不足”被撤销或终止。
• 例外情形：若违法行为涉及公共安全、环境保护等重大利益，行政机关可依据《行政处罚法》第五十四条，通过公告送达、委托调查等方式穷尽调查手段，仍无法查找的，可依法结案并记录在案。
• 实务提示：行政机关需留存调查记录（如走访记录、公告凭证等），证明已履行法定调查义务，避免因程序瑕疵被复议或诉讼撤销。

3. 实务建议：分情况处理

• 情况一：案件未超过时效且可补充证据
  行政机关应继续调查，通过技术手段（如监控追踪、数据比对）或社会公告（如媒体发布、社区张贴）查找违法行为人。若成功找到，可依法作出处罚；若仍无法找到，可依据《行政处罚法》第五十七条，以“证据不足”为由撤销案件。
• 情况二：案件已超过时效或执行期限
  行政机关应依法终止程序，并书面告知当事人或利害关系人。若涉及公共利益损害，可建议通过民事诉讼（如环境损害赔偿）或刑事报案（如涉嫌犯罪）另行救济。
• 情况三：违法行为人身份明确但下落不明
  行政机关可申请法院宣告其为失踪人，并依据《民法典》第四十三条，指定财产代管人代为履行义务（如缴纳罚款）。若财产不足，可终结执行程序。

总结：行政案件十二年未找到违法行为人，需优先核查时效与执行期限，再结合案件性质选择终止、中止或补充调查。实务中，行政机关应严格遵循法定程序，避免因程序违法被复议或诉讼撤销。如有具体案件细节，可进一步提供信息以便精准分析。