不可以直接从工人手里收回已发放工资再由公司重新发放，这种做法存在法律风险和操作问题，具体分析如下：

1. 法律层面
   根据《劳动法》及《工资支付暂行规定》，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或无故拖欠。若甲方已代发工资，公司再要求工人返还，可能涉嫌以下违法情形：

   • 克扣工资：若工人未同意返还，公司强行扣回，属于违法行为，工人可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
     
   • 未及时足额支付：若公司收回后未及时重新发放，可能面临支付赔偿金的风险（如按应付金额50%-100%加付赔偿金）。
     

2. 操作层面

   • 工人配合问题：工人可能拒绝返还已收到的工资，尤其是当甲方代发行为合法时（如甲方与工人存在实际用工关系）。
     
   • 资金流转风险：若公司收回工资后未及时重新发放，可能导致工人生活困难，引发劳动纠纷。
     
   • 税务风险：重复发放工资可能涉及个人所得税申报错误，需调整申报记录，否则可能面临税务处罚。
     

3. 合规建议

   • 协商解决：若甲方代发行为存在错误（如金额错误、对象错误），应与工人协商一致后，由甲方出具书面说明并退回款项，再由公司重新发放。
     
   • 完善流程：公司应与甲方明确代发工资的协议条款，避免权责不清。例如，约定代发错误时的处理方式、资金返还路径等。
     
   • 法律文书：若需工人返还工资，应签订书面协议，明确返还原因、金额及重新发放时间，避免口头约定。
     

总结：直接从工人手里收回工资再发放的操作风险极高，建议通过协商、完善协议等合法方式解决。若涉及复杂纠纷，可进一步向我咨询具体方案。