关于您提出的“用农民工专户发工资就能确认劳动关系吗”这一问题，我们需要从法律的角度进行详细分析。

首先，我们要明确的是，工资支付凭证或工资记录确实是证明劳动关系存在的关键性证据之一。当企业通过农民工专户代发工资时，如果能够提供相应的支付凭证，这确实为证明劳动关系的存在提供了一定的依据。

然而，仅仅依靠工资支付凭证或通过农民工专户发工资这一行为，并不能直接、绝对地确认劳动关系的存在。因为劳动关系的确认是一个综合考量的过程，它不仅仅依赖于工资支付这一单一因素。

根据《劳动合同法》的相关规定，建立劳动关系应当订立书面劳动合同。这是确认劳动关系最直接、最有效的法律文件。如果用人单位与劳动者之间已经订立了书面劳动合同，并且合同中明确规定了双方的权利和义务，那么劳动关系的存在就是毋庸置疑的。

此外，即使没有书面劳动合同，劳动关系的确认也需要综合考虑其他因素，如劳动者是否实际接受了用人单位的管理、是否从事了用人单位安排的工作、是否获得了用人单位提供的劳动条件等。

因此，虽然农民工专户代发工资可以作为证明劳动关系存在的一个方面，但并不能单独作为确认劳动关系的唯一依据。要确认劳动关系的存在，还需要综合考虑其他相关因素，并依据法律法规进行综合判断。

综上所述，用农民工专户发工资并不能直接确认劳动关系的存在，而是需要综合考虑多种因素，并依据相关法律法规进行综合判断。希望这个解答能够对您有所帮助。