若申请劳动仲裁时公司不出席，仲裁程序仍会继续进行，且公司可能会因此承担不利的仲裁结果。具体来说，可以从以下几个方面进行分析：
仲裁程序的继续进行：
- 即使公司未出席仲裁庭，仲裁程序也不会因此中断。仲裁庭会依据现有证据进行审理，包括劳动者所提交的证据。
- 若劳动者提交的证据能形成完整的证据链，证明其主张，仲裁庭会予以审查和采信。
公司放弃的权利：
- 公司不出席仲裁庭，意味着其放弃了当庭答辩、质证及辩论等权利。
- 这可能导致公司无法对劳动者提出的证据和观点进行有效反驳，从而使仲裁庭更有可能依据劳动者的主张和证据作出裁决。
缺席裁决的法律依据与后果：
- 根据《劳动争议调解仲裁法》的相关规定，被申请人（即公司）经书面通知，无正当理由拒不到庭或者未经仲裁庭许可中途退庭的，可以缺席裁决。
- 仲裁庭可依法缺席裁决，若查明事实清楚、证据确凿，会根据相关法律法规作出公正的裁决。裁决结果对公司同样具有法律效力。
- 若公司之后对仲裁结果不服，在符合法律规定的情况下，仍可通过诉讼等程序进行救济，但不能以未出席仲裁为由随意否定仲裁裁决的效力。
公司可能面临的风险：
- 公司缺席仲裁的风险极大，会丧失在仲裁阶段充分表达意见、提供证据反驳对方主张的机会。
- 极可能承担不利的仲裁结果，即便公司后续对仲裁结果不服向法院起诉，也可能因之前未充分参与仲裁而陷入被动。
建议与提醒：
- 公司应重视劳动仲裁程序，收到仲裁通知后应按时出庭，并准备好相关证据和答辩材料。
- 若确实有正当理由无法出庭，需提前向仲裁庭说明并申请延期，以维护自身合法权益。
- 对于劳动者而言，应确保提交的证据充分、合法，以支持自己的主张。
举例说明：
假设劳动者主张公司未按时足额支付工资，并提交了工资条、银行流水等证据。若公司未出席仲裁庭，仲裁庭在审查这些证据后，若认为证据充分且合法，很可能会支持劳动者的请求，裁决公司支付拖欠的工资及可能的赔偿金。
后续行动建议：
- 若您正面临劳动仲裁相关问题，且对公司不出庭的判决结果有所担忧，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。
- 同时，建议您在劳动仲裁过程中保持与仲裁庭的沟通，及时了解案件进展，并根据需要补充或调整证据材料。