结论前置：国企单位总经理擅自发奖金是否违法，需结合具体情况判断，主要涉及是否违反公司章程、财务制度及国有资产监管规定。以下分情况说明：
1. 若违反公司章程或内部财务制度
国企总经理的奖金发放权限通常由公司章程或内部财务制度明确规定（如需经董事会、职代会或上级主管部门审批）。若总经理未经法定程序擅自发放奖金，可能构成越权行为，违反《公司法》或企业内部治理规则，需承担内部管理责任（如被责令追回奖金、警告或撤职）。
法律依据：《公司法》第46条（经理职权需依章程行使）、《企业国有资产法》第30条（国有独资企业重大事项需经履行出资人职责的机构决定）。
2. 若涉及国有资产流失
国企奖金发放需符合国资监管要求（如工资总额管理、效益联动等）。若总经理擅自发放奖金导致国有资产损失（如超标准发放、虚构业绩发放），可能构成违反财经纪律，需承担行政责任（如处分、罚款）或刑事责任（如涉嫌贪污、挪用公款）。
法律依据：《企业国有资产监督管理暂行条例》第38条（禁止违规决策导致国有资产损失）、《刑法》第168条（国有公司人员失职罪）。
3. 若程序合法但实体不公
即使总经理按程序发放奖金，若存在不公平（如仅向特定人员发放、与业绩严重不符），可能引发内部纠纷或违反《劳动合同法》中的公平原则，员工可主张权利（如要求同等对待或追偿）。
4. 例外情形：紧急或授权情况
若总经理因紧急情况（如突发事故奖励）或已获合法授权（如董事会临时授权）发放奖金，且符合制度要求，则不违法。
建议：
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