逾期付款对方已收款后，事后主张违约金是否合法，需视具体情况而定。以下从不同角度进行分析：

1. 合同有明确约定

• 合法性：若合同中明确约定了逾期付款的违约金条款，且该条款不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，那么在逾期付款后，即使对方已经收款，守约方仍有权依据合同约定主张违约金。
• 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》第五百八十五条：“当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。”
• 建议：在此情况下，守约方应仔细审查合同条款，确保违约金条款的有效性，并按照合同约定的程序主张权利。

2. 合同无明确约定，但法律有规定

• 合法性：若合同未约定违约金，但法律对逾期付款的违约责任有明确规定（如某些特定类型的合同），则守约方可以依据法律规定主张违约金或损失赔偿。
• 法律依据：例如，在买卖合同中，若卖方逾期交货或买方逾期付款，且合同未约定违约金，但根据《中华人民共和国民法典》中关于买卖合同的规定，违约方可能需要承担赔偿损失的责任。不过，直接主张“违约金”可能缺乏合同依据，但可通过主张实际损失来间接实现类似效果。
• 建议：在此情况下，守约方应收集相关证据，证明因对方逾期付款所造成的实际损失，并依据法律规定主张赔偿。

3. 合同无明确约定，且法律无直接规定

• 合法性：若合同未约定违约金，且法律对逾期付款的违约责任无直接规定，则守约方事后主张违约金可能缺乏法律依据。但守约方仍可以主张因对方违约所造成的实际损失。
• 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》第五百七十七条：“当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定的，应当承担继续履行、采取补救措施或者赔偿损失等违约责任。”
• 建议：守约方应收集并保留因对方逾期付款所造成的实际损失的证据，如利息损失、额外费用支出等，并据此向对方主张赔偿。

4. 特殊情况：对方放弃或免除违约金

• 合法性：若在逾期付款后，双方通过协商或其他方式明确约定放弃或免除违约金，则守约方事后不得再主张违约金。
• 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人有权通过协商变更或解除合同，包括放弃或免除违约金。
• 建议：在此情况下，守约方应尊重双方的约定，不得再主张违约金。但若对方存在欺诈、胁迫等情形导致守约方放弃或免除违约金，守约方可以依法主张撤销该约定。

总结与建议：

• 逾期付款对方已收款后，事后主张违约金是否合法，主要取决于合同是否有明确约定以及法律是否有相关规定。
• 若合同有明确约定且合法有效，守约方可以依据合同主张违约金。
• 若合同无明确约定但法律有规定，守约方可以依据法律规定主张赔偿。
• 若合同无明确约定且法律无直接规定，守约方可以主张实际损失。
• 在任何情况下，守约方都应收集并保留相关证据，以支持自己的主张。

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