扣三天工资是否算上加班，这主要取决于扣工资的具体原因和公司的规章制度，但通常情况下，扣三天工资并不直接涉及加班工资的计算。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
一、扣工资的原因与性质
旷工或违反公司规定：
- 如果员工因旷工或违反公司规定而被扣三天工资，这通常是对员工违规行为的惩罚，与加班工资无直接关联。
- 根据《工资支付暂行规定》，旷工当天，用人单位可以不支付工资，但除非给用人单位造成了经济损失，否则不得额外扣工资。即使扣除，每月扣除的部分也不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资部分不得低于当地月最低工资标准。
加班工资的计算：
- 加班工资是员工在超出正常工作时间外工作所应得的额外报酬。
- 加班工资的计算通常基于员工的正常工资和加班时间，与是否被扣工资无直接关系。
二、公司规章制度的影响
- 公司的规章制度可能规定了扣工资的具体情形和金额，但这些规定必须符合法律法规的要求。
- 如果公司规章制度中规定扣三天工资包括加班工资，且该规定不违反法律法规，那么从公司内部管理的角度来看，可能是有效的。但这样的规定在法律上可能存在争议，因为加班工资是员工应得的报酬，不应被随意扣除。
三、法律建议与后果
法律建议：
- 员工应仔细阅读公司的规章制度，了解扣工资的具体原因和金额。
- 如果认为公司的扣工资行为违反了法律法规或劳动合同的约定，员工可以与公司协商解决，或向劳动监察部门投诉。
可能的法律后果：
- 如果公司无正当理由扣工资，员工有权要求公司补发工资，并可能获得相应的赔偿。
- 如果公司规章制度中的扣工资规定违反了法律法规，该规定可能被认定为无效。
总结来看，扣三天工资是否算上加班，主要取决于扣工资的原因和公司的规章制度。但通常情况下，扣工资是对员工违规行为的惩罚，与加班工资无直接关联。如果员工对公司的扣工资行为有异议，建议与公司协商解决或向劳动监察部门投诉。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。