合同中原本约定的月薪6000元变为综合工资6000元，这种情况是有可能发生的，但关键在于合同的具体条款和双方的理解与约定是否一致。以下从几个角度进行详细分析：
一、合同条款的明确性
月薪与综合工资的区别：
- 月薪通常指的是每月固定的工资数额，不包含其他变动部分。
- 综合工资则可能包含基本工资、奖金、津贴、补贴等多个部分，其总额可能与月薪相同，但各部分构成和发放条件可能有所不同。
合同条款的变更：
- 如果合同中原本明确约定了月薪为6000元，而后来变更为综合工资6000元，这实际上是对合同条款的修改。
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动合同的变更应当遵循平等自愿、协商一致的原则，并采用书面形式。因此，如果双方同意将月薪变更为综合工资，并签订了书面变更协议，那么这种变更是合法的。
二、双方的理解与约定
双方对综合工资的理解：
- 在签订合同时，双方应对综合工资的具体构成和发放条件有明确的理解。如果双方对综合工资的理解存在分歧，可能导致后续纠纷。
- 例如，如果综合工资中包含了难以达到的业绩奖金，而劳动者实际无法获得这部分奖金，那么其实际收入可能会低于原本的月薪6000元。
约定的一致性：
- 双方在合同变更过程中应确保约定的一致性。如果变更后的综合工资条款存在模糊或不明确的地方，可能导致双方对合同的理解产生分歧。
三、法律建议与风险提示
审查合同条款：
- 在签订或变更劳动合同时，劳动者应仔细审查合同条款，特别是关于劳动报酬的部分。确保合同条款明确、具体，避免模糊或不明确的地方。
保留证据：
- 如果双方对合同条款存在分歧或争议，劳动者应保留相关证据，如合同文本、变更协议、沟通记录等。这些证据在后续解决纠纷时可能起到关键作用。
及时维权：
- 如果劳动者认为用人单位侵犯了其劳动保障合法权益，如未按照合同约定支付劳动报酬等，应及时向劳动保障监察机构举报投诉或依法申请劳动争议仲裁。
举例说明：假设小李与用人单位签订了一份劳动合同，原本约定月薪为6000元。后来，双方协商一致将月薪变更为综合工资6000元，其中基本工资为4000元，奖金为2000元（需达到一定业绩条件方可获得）。如果小李能够达到业绩条件并获得全额奖金，那么其实际收入与原本的月薪相同。但如果小李无法达到业绩条件，那么其实际收入将低于原本的月薪。因此，在签订或变更劳动合同时，双方应对综合工资的具体构成和发放条件有明确的理解和约定。
总结与建议：合同中原本约定的月薪6000元变为综合工资6000元是有可能发生的，但关键在于合同的具体条款和双方的理解与约定是否一致。在签订或变更劳动合同时，劳动者应仔细审查合同条款，确保合同条款明确、具体，并保留相关证据以备不时之需。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。