民事诉讼一审因管辖权限裁定驳回原告诉讼后，原告已经交过的诉讼费用，法院应当退还。以下是对此问题的详细分析：

一、法律依据

根据《诉讼费用交纳办法》第八条的规定，下列案件不交纳案件受理费，其中就包括“裁定不予受理、驳回起诉、驳回上诉的案件”。同时，该办法第二十七条也明确指出，第一审人民法院裁定不予受理或者驳回起诉的，应当退还当事人已交纳的案件受理费。因此，从法律层面来看，原告在因管辖权限问题被裁定驳回起诉后，其已交纳的诉讼费用应当得到退还。

二、退费流程

1. 准备材料：原告需要准备好相关的缴费凭证、判决书等生效法律文书，以及身份证等个人身份证明材料。
2. 联系主办法官：给主办法官打电话约好时间，找他签字“同意退费”。
3. 询问签字程序：主办法官签字后，跟主办法官询问，是否需要主管副院长签字。
4. 办理退费手续：如果不需要主管院长签字，或者主管院长已经签了字，询问财务室什么时候办理退费，以及财务室的电话。在去之前，务必再核对一下所需材料是否带齐。
5. 确认财务在岗：办事之前先给财务打电话，确认他到底在不在。如果没人接电话，不要去，财务室没人。接了电话，确认他上班了，再告诉他几点到。

三、注意事项

1. 及时申请：原告在收到驳回起诉的裁定后，应及时按照法院的退费流程申请退费，以免错过退费期限。
2. 保留证据：在申请退费过程中，原告应保留好所有相关的缴费凭证、判决书等生效法律文书，以及与法院沟通的记录，以备不时之需。
3. 上诉权利：如果原告对驳回起诉的裁定不服，可以在法定期限内提起上诉。但需要注意的是，上诉并不影响退费的申请和办理。

四、特殊情况

虽然因管辖权限问题被裁定驳回起诉后，原告的诉讼费用应当得到退还，但也有一些特殊情况需要注意。例如，如果原告的诉讼行为存在不合程序的问题，虽然诉讼费用可以退还，但原告可能需要承担其他法律后果。不过，这种情况并不影响诉讼费用的退还本身。

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