货款过了三年还有一部分未还，其诉讼时效是否从最后一次付款时间重新计算，这主要取决于最后一次付款行为是否构成对原债务的重新确认。以下是对此问题的详细分析：
一、诉讼时效的基本规定
根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间通常为三年。这一期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。在货物买卖合同纠纷中，若货款未按时支付，债权人应在知道或应当知道权利受损之日起三年内提起诉讼，否则可能面临诉讼时效届满的风险。
二、最后一次付款行为的影响
构成对原债务的重新确认：
- 如果债务人在诉讼时效期间内进行了最后一次付款，并且这一行为被明确视为对原债务的重新确认（例如，付款时明确注明了是支付哪笔货款的剩余部分），那么诉讼时效可能会从最后一次付款时间起重新计算。
- 这种情况下，最后一次付款行为相当于债务人承认了债务的存在，并愿意继续履行，因此诉讼时效得以延长。
不构成对原债务的重新确认：
- 如果最后一次付款行为并未明确表明是对原债务的重新确认，或者债务人只是支付了部分款项而未对剩余债务作出任何表示，那么诉讼时效可能不会从最后一次付款时间起重新计算。
- 在这种情况下，债权人仍需在原诉讼时效期间内提起诉讼，否则可能面临诉讼时效届满的风险。
三、实际操作中的建议
保留证据：
- 债权人应妥善保留与债务人之间的所有交易记录和付款凭证，包括最后一次付款的相关证据。这些证据在诉讼中可能起到关键作用，有助于证明诉讼时效的重新计算或债务的存在。
及时主张权利：
- 无论诉讼时效是否从最后一次付款时间起重新计算，债权人都应及时主张自己的权利。如果发现债务人未按时支付货款，应尽快与债务人沟通并寻求解决方案。如果沟通无果，应及时向法院提起诉讼以维护自己的合法权益。
咨询专业律师：
- 在处理此类纠纷时，债权人可以咨询专业律师以获取更具体的法律建议。律师可以根据具体情况分析诉讼时效的问题，并帮助债权人制定合适的诉讼策略。不过，作为王思宇律师，我随时准备为你提供法律咨询，你可以直接向我提问。
综上所述，货款过了三年还有一部分未还时，其诉讼时效是否从最后一次付款时间重新计算取决于最后一次付款行为是否构成对原债务的重新确认。债权人应保留相关证据并及时主张自己的权利，如有需要可以随时向我咨询。