可以起诉。针对您提出的“包工头在合同期限内超一年多是否可以起诉”的问题，我将从多个角度为您详细分析。
一、合同期限与诉讼时效的基本概念
首先，我们需要明确合同期限和诉讼时效的概念。合同期限是指合同双方约定的合同有效存续的时间段。而诉讼时效，根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，是指权利人在法定期间内不行使权利，即丧失请求法院依法保护其民事权利的权利的制度。对于一般的民事纠纷，诉讼时效期间通常为三年，自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。
二、包工头合同期限超期的法律后果
合同履行问题：
- 如果包工头在合同期限内未能完成合同约定的义务，且超期一年多仍未完成，这首先构成合同违约。违约方（包工头）可能需要承担违约责任，包括但不限于赔偿损失、支付违约金等。
诉讼时效的适用：
- 假设合同中约定了明确的履行期限，且包工头在期限内未履行完毕，那么从合同履行期限届满之日起，权利人（如发包方）就应当知道自己的权利可能受到了损害。此时，诉讼时效开始计算。
- 如果权利人在诉讼时效期间内（通常为三年）未提起诉讼或仲裁，且没有诉讼时效中断、中止等法定情形，那么其请求法院保护其民事权利的权利可能会丧失。但需要注意的是，即使诉讼时效期间已过，权利人仍然可以起诉，只是对方可能提出诉讼时效抗辩，导致权利人败诉。
三、可以起诉的具体情形
诉讼时效未过期：
- 如果从合同履行期限届满之日起计算，尚未超过三年（或法律规定的更长诉讼时效期间），那么权利人可以起诉包工头，要求其承担违约责任。
诉讼时效已过期但存在中断、中止情形：
- 如果诉讼时效期间已经超过，但存在诉讼时效中断（如权利人向义务人提出履行请求、义务人同意履行义务等）或中止（如不可抗力、权利人被义务人或者其他人控制等）的法定情形，且这些情形发生在诉讼时效期间的最后六个月内，那么诉讼时效期间将重新计算或暂停计算。此时，权利人仍然可以起诉。
对方未提出诉讼时效抗辩：
- 即使诉讼时效期间已经超过，如果对方在诉讼中未提出诉讼时效抗辩，法院也不会主动适用诉讼时效规定进行裁判。因此，权利人仍然有可能获得法院的支持。
四、建议与注意事项
及时行使权利：
- 权利人应当在知道或应当知道权利受到损害之日起及时行使权利，避免诉讼时效期间过期。
保留证据：
- 权利人应当保留好与合同履行相关的证据，如合同文本、履行记录、沟通记录等，以便在诉讼中证明自己的主张。
咨询专业律师：
- 如果您对诉讼时效、合同违约等法律问题存在疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。作为专业律师，我将根据您的具体情况提供有针对性的法律建议。
综上所述，包工头在合同期限内超一年多未履行完毕合同义务的，权利人仍然可以起诉，但需要注意诉讼时效的问题。如果您有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。