周六加班请假扣工资是不合法的。以下从不同角度为您详细分析：
一、法律规定角度
加班性质与工资支付：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第四十四条，休息日（如周六）安排劳动者工作又不能安排补休的，用人单位应支付不低于工资的百分之二百的工资报酬作为加班费。这表明，周六加班本身已经获得了额外的工资报酬。
- 若员工在周六加班后请假，用人单位不应因此扣除已支付的加班费，因为加班费是对员工额外工作时间的补偿，与请假无关。
工资支付原则：
- 《中华人民共和国劳动法》第五十条规定，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这一原则同样适用于加班后的请假情况，用人单位不得因员工请假而克扣其工资或加班费。
二、实际操作角度
请假与工资扣除的合理性：
- 员工在周六加班后请假，通常是因为个人原因或突发情况。在这种情况下，用人单位应依据劳动合同和单位规章制度来处理请假事宜，但不得违反法律关于不得克扣工资的规定。
- 如果用人单位的规章制度中规定了请假工资的扣除方式，但这些规定违反了法律强制性规定，那么这些规定是无效的。员工有权拒绝不合理的工资扣除。
证据保留与维权：
- 员工在遇到周六加班请假被扣工资的情况时，应保留好加班通知、请假申请及批复记录等证据。这些证据在后续维权过程中将起到关键作用。
- 如果与用人单位协商无果，员工可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，通过法律手段维护自己的合法权益。
三、特殊情况处理
强制加班与请假：
- 如果用人单位未经协商强制员工周六加班，并在员工请假后扣工资，这是不合法的。员工有权拒绝强制加班，并因请假被扣工资而维权。
单位规章制度与法律冲突：
- 如果用人单位的规章制度中关于请假工资扣除的规定与法律相冲突，员工应依据法律来维护自己的权益。在这种情况下，法律优先于单位规章制度。
建议与措施：
- 友好协商：首先尝试与用人单位进行友好协商，要求解释扣工资的原因并纠正不当行为。
- 法律途径维权：若协商无果，及时向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，通过法律手段维护自己的合法权益。
- 证据保留：在整个过程中，务必保留好所有相关证据，以备不时之需。
总之，周六加班请假扣工资是不合法的。员工应了解自己的合法权益，并在必要时采取适当的措施来维护这些权益。如果您有任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。