针对您提出的问题，即司机未与对方仓库核对数量导致对方多搬一件货，责任是否在于我方仓库，这并非一个简单的“是”或“否”的问题，而是需要从多个角度进行深入分析：
合同条款与约定：
- 首先，需要审查双方签订的合同或协议中是否有关于货物搬运、数量核对以及责任划分的具体条款。如果合同中明确规定了双方在货物搬运过程中的核对义务以及责任承担方式，那么应首先遵循合同约定。
- 若合同中未明确规定，则需依据行业惯例或交易习惯来判断。在物流或仓储行业中，通常会有一定的核对流程和责任划分机制。
过错原则与责任承担：
- 根据过错原则，如果司机在搬运过程中未履行与对方仓库核对数量的义务，且这一行为直接导致了对方多搬货物，那么司机（或其代表的仓库）可能存在一定的过错。
- 然而，要确定责任是否完全在于我方仓库，还需考虑对方仓库在接收货物时的核对义务。如果对方仓库在接收时也未进行必要的核对，那么对方也可能承担一定的责任。
实际损失与赔偿：
- 如果多搬的货物造成了实际损失（如货物价值、运输费用等），那么受损方有权要求责任方进行赔偿。
- 赔偿金额的确定通常基于实际损失的大小，以及双方在事故中的过错程度。如果双方均有过错，则可能按照过错比例分担赔偿责任。
预防措施与未来合作：
- 为了避免类似事故的再次发生，双方应加强沟通与合作，明确各自在货物搬运过程中的责任和义务。
- 可以考虑建立更加完善的核对机制，如使用电子标签、扫描设备等手段来确保货物的准确搬运。
法律建议：
- 在处理此类纠纷时，建议双方首先通过友好协商的方式解决。如果协商无果，可以考虑寻求第三方调解或仲裁机构的帮助。
- 如果纠纷涉及金额较大或法律关系复杂，建议及时咨询专业律师，以便更好地维护自身权益。
可能后果：
- 如果责任被认定在我方仓库，且未及时采取补救措施或进行赔偿，可能会面临法律诉讼和相应的赔偿责任。
- 长期来看，此类纠纷还可能影响双方未来的合作关系和商业信誉。
总结：司机未与对方仓库核对数量导致对方多搬一件货的责任问题，并非单一责任方的过错，而是需要从合同条款、过错原则、实际损失与赔偿以及预防措施等多个角度进行综合分析。在处理此类纠纷时，建议双方保持冷静和理性，通过友好协商或法律途径来解决问题。如果您在此方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。