在农业设施用地上建粮食仓库是否算违建，需根据具体情况判断，关键在于是否依法办理了相关审批手续，以及房屋的实际用途是否符合农业生产需要和土地使用规划。以下是对此问题的详细分析：
一、不构成违建的合法情形
符合设施农业用地规定：
- 根据相关规定，若建粮食仓库作为农业生产必要的配套设施（如用于农产品的临时存储等），并依法办理了设施农业用地备案等手续，则不属于违建。
- 此类建设需在规定的用地规模和建设标准内进行，且直接服务于农业生产。
办理农用地转建设用地审批：
- 若设施农用地已依法转为建设用地，并完成了相关审批手续，则在该土地上建造的粮食仓库合法，不构成违建。
- 这包括农业生产设施用房和农业附属设施用房，只要它们符合规定用途和标准。
符合乡村规划：
- 在某些情况下，即使是在农业设施用地上建粮食仓库，如果建设行为符合当地乡村规划，并获得了相关部门的许可（如乡镇政府的审核批准），也不构成违建。
二、构成违建的违法情形
擅自改变土地用途：
- 若在农业设施用地上建设的粮食仓库并非用于农业生产配套设施，而是改为非农业用途（如商业用房、工厂等），则属于擅自改变土地用途，构成违建。
未办理相关审批手续：
- 即使建粮食仓库旨在服务农业生产，但若未按规定办理设施农业用地备案或其他必要审批手续，也可能被认定为违建。
超出规定面积和标准：
- 即使办理了相关手续，若建设的粮食仓库超出了规定的用地规模和建设标准，超出部分仍可能被认定为违建。
违反土地使用规划：
- 将农业设施用地上的粮食仓库用于与农业生产无关的目的，或建造非农业设施，均违反了土地使用规划，视为违建。
三、法律后果与建议
- 法律后果：若被认定为违建，可能面临行政处罚，包括责令限期拆除、罚款等。在严重情况下，还可能涉及刑事责任。
- 建议：为避免法律风险，建议在使用农业设施用地建粮食仓库前，务必咨询当地自然资源和规划部门或农业农村部门，了解具体的政策和要求，确保建设行为合法合规。同时，应严格遵守相关法律法规和规章制度，确保农业设施用地的合理使用和开发。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。我会根据你的具体情况，提供更为详细和专业的法律建议。