旷工三天不能跑单子，但工资仍可结算，不过需扣除旷工期间的工资，并根据公司规章制度和法律限制进行可能的罚款和赔偿扣除。以下是对此问题的详细分析：
一、工资计算原则
- 按劳取酬：根据《劳动法》的规定，薪酬分配应遵循按劳取酬原则。这意味着，员工只要提供了劳动力，雇主就需要支付相应的报酬。
- 扣除旷工工资：员工旷工的三天未工作，因此这三天不计入薪资计算范畴。即，旷工期间的工资不予发放。
二、正常出勤与旷工影响
- 正常出勤部分工资：员工正常出勤的天数，应按照劳动合同约定的工资标准和实际出勤天数进行计算。例如，如果月工资为5000元，每月计薪天数为21.75天，当月正常出勤15天，则正常出勤工资为\(5000{\\div}21.75\\times15\)。
- 旷工扣罚：
- 用人单位不能因旷工扣除员工全部工资。每月扣除的工资不得超过劳动者当月工资的20%。
- 若公司有明确的旷工处罚规定（如罚款），需在扣除旷工工资后，按照不超过薪资收入20%的比例执行，且剩余工资不得低于当地月最低工资标准。
- 具体扣罚需依据公司依法制定并公示的规章制度，该制度需通过民主程序制定，并向劳动者公示或告知。
三、经济损失赔偿与罚款
- 若员工旷工行为给公司造成经济损失，公司可依据相关规定和证据，从员工工资中扣除相应的赔偿金额。但扣除后的剩余工资仍需满足上述法律限制，即不得低于当地月最低工资标准，且每月扣除的工资不得超过劳动者当月工资的20%。
四、工资结算时间与方式
- 约定时间结算：如果劳动合同或公司工资支付制度有明确约定，应按照约定时间支付工资。
- 解除劳动关系时结算：员工旷工三天自离导致劳动关系解除时，公司应一次性付清员工剩余工资。若未按时支付，员工有权通过合法途径维权，如向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
五、员工权益保障
- 员工在离职后发现公司存在无合理理由克扣工资的行为，有权采取相应措施维护自身权益，包括但不限于向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
建议与提醒：
- 员工应了解自己的权益，包括工资计算方式、旷工扣罚规定等，以便在发生争议时能够维护自己的合法权益。
- 如果公司存在无合理理由克扣工资的行为，员工应及时向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
- 如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。