针对您提出的“合同没有约定预付款比例，后面要签补充协议吗”这一问题，我的结论是：是否签订补充协议，需根据具体情况和双方意愿来决定，但签订补充协议通常是一个更为稳妥和明确的做法。以下是我从不同角度为您进行的分析：
一、法律层面分析
合同自由原则：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同双方有权在平等、自愿的基础上协商确定合同内容，包括预付款的比例。如果原合同未约定预付款比例，双方完全可以通过签订补充协议来明确这一条款。
合同完整性：一个完整的合同应当明确双方的权利和义务，包括付款方式、付款时间等关键条款。如果原合同缺乏预付款比例的约定，可能会导致合同执行过程中的不确定性和争议。因此，从合同完整性的角度来看，签订补充协议是有益的。
二、实践层面分析
避免争议：在实际操作中，如果合同未明确预付款比例，双方可能会在执行过程中产生分歧。例如，一方可能认为预付款比例应较高，而另一方则可能认为应较低。这种分歧如果无法及时解决，可能会影响合同的顺利执行。通过签订补充协议，可以明确预付款比例，从而避免潜在的争议。
保障权益：对于收款方而言，明确的预付款比例可以保障其资金流的稳定性和可预测性。对于付款方而言，明确的预付款比例也可以帮助其更好地规划资金使用和预算安排。因此，从保障双方权益的角度来看，签订补充协议也是有益的。
三、建议与操作
沟通协商：如果双方认为有必要明确预付款比例，建议首先进行沟通协商，就预付款比例达成一致意见。
签订补充协议：在沟通协商的基础上，双方可以签订补充协议，明确预付款的比例、支付时间等关键条款。补充协议应当采用书面形式，并由双方签字或盖章确认。
法律审查：在签订补充协议前，建议双方对协议内容进行法律审查，确保协议内容合法、有效，并符合双方的意愿和利益。
综上所述，虽然原合同未约定预付款比例并不必然导致合同无效或无法执行，但签订补充协议可以明确双方的权利和义务，避免潜在的争议和风险。因此，如果双方认为有必要，建议签订补充协议来明确预付款比例。如果您在此过程中有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。