放假三个月发最低工资，然后再赔偿的合法性需根据具体情况分析。以下是对此问题的详细分析：

一. 放假期间工资支付规定

1. 根据《工资支付暂行规定》第十二条，非因劳动者原因造成单位停工、停产在一个工资支付周期内的，用人单位应按劳动合同规定的标准支付劳动者工资。超过一个工资支付周期的，若劳动者提供了正常劳动，则支付给劳动者的劳动报酬不得低于当地的最低工资标准；若劳动者没有提供正常劳动，应按国家有关规定办理。

• 例如，若公司因经营困难决定放假三个月，且这并非劳动者原因造成，那么在第一个工资支付周期内，公司应按劳动合同规定的标准支付工资；超过此周期，若劳动者未提供正常劳动，公司需按国家相关规定支付工资，但不得低于最低工资标准。

二. 赔偿的合法性

1. 赔偿通常是在违反法律规定或合同约定的情况下，对受损方进行的经济补偿。若公司放假三个月并发最低工资的行为本身没有违反法律规定或合同约定，那么后续的“赔偿”就缺乏法律依据。
2. 若公司放假期间未按照法律规定支付工资，或存在其他违法行为，导致劳动者权益受损，那么劳动者有权要求公司赔偿。此时，赔偿是合法的，且赔偿金额应能弥补劳动者的实际损失。

三. 结论

• 若公司放假三个月并发最低工资的行为符合法律规定和合同约定，那么后续的“赔偿”就可能是不合法的，因为这可能构成无故支付或滥用资金。
• 若公司存在违法行为，导致劳动者权益受损，那么劳动者有权要求公司赔偿，且赔偿是合法的。

我建议，在处理此类问题时，应首先审查公司放假期间工资支付的行为是否合法，以及是否存在其他违法行为。若存在违法行为，劳动者可以依法要求公司赔偿；若不存在违法行为，那么后续的“赔偿”就可能是不必要的，甚至可能构成不当得利。如有进一步需要，您可以继续咨询我。