关于亲奶奶过世请假两天是否要扣底薪的问题，这主要取决于您所在单位的具体规章制度以及您与单位签订的劳动合同中的相关约定。以下是从不同角度进行的分析：
单位规章制度：
- 许多单位会制定自己的请假和薪资扣除制度。这些制度通常会明确规定在何种情况下可以请假，以及请假期间薪资的扣除方式。
- 如果您所在单位的规章制度中明确规定了因直系亲属（如奶奶）过世而请假的，不扣除底薪或按一定比例扣除，那么您应按照该规定执行。
- 如果规章制度中没有明确规定，或者规定与您的期望不符，您可以与单位进行协商，看是否能够达成一致意见。
劳动合同约定：
- 劳动合同是您与单位之间约定双方权利和义务的重要文件。其中可能会包含关于请假和薪资扣除的条款。
- 如果劳动合同中明确规定了因直系亲属过世而请假的薪资处理方式，那么您应遵守该约定。
- 如果劳动合同中没有相关约定，或者约定不明确，您可以参考单位的一般做法或行业惯例，与单位进行协商。
法律法规：
- 在我国，劳动法等相关法律法规并没有明确规定因直系亲属过世而请假时薪资的具体扣除方式。这通常属于单位自主管理的范畴。
- 但是，如果单位的规章制度或劳动合同中的规定违反了法律法规的强制性规定（如最低工资标准等），那么这些规定将是无效的。
建议：
- 首先，查看您所在单位的规章制度和您与单位签订的劳动合同，了解其中关于请假和薪资扣除的具体规定。
- 如果规章制度或劳动合同中没有明确规定，或者规定与您的期望不符，您可以与单位的人力资源部门或相关负责人进行沟通，说明您的情况，并尝试达成一致意见。
- 如果沟通无果，您可以考虑向当地的劳动监察部门投诉或寻求法律援助，以维护自己的合法权益。
最后需要强调的是，每个单位的情况都可能不同，因此无法给出一个统一的答案。在处理此类问题时，最重要的是了解并遵守您所在单位的具体规定，同时积极与单位进行沟通协商。如果您有任何疑问或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。