建设工程施工合同纠纷不涉及工程款的决算问题，仍然不适用专属管辖，而是按照一般合同纠纷的管辖原则或双方当事人的约定来确定管辖法院。以下是对此问题的详细分析：
一、法律依据与解释
《民事诉讼法》相关规定：
- 根据《中华人民共和国民事诉讼法》第三十五条（原第三十四条，2021年修正后条款序号调整），因不动产纠纷提起的诉讼，由不动产所在地人民法院专属管辖。但此处的“不动产纠纷”应理解为不动产物权纠纷，如物权设立、权属、变更、转让等引起的纠纷。建设工程施工合同纠纷并不直接涉及不动产物权的确认或变动，而是基于施工合同的履行产生的债权债务关系。
司法解释明确排除：
- 虽然《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国民事诉讼法〉的解释》第二十八条第二款曾规定农村土地承包经营合同纠纷、房屋租赁合同纠纷、建设工程施工合同纠纷、政策性房屋买卖合同纠纷，按照不动产纠纷确定管辖，但该条款在后续司法实践中被进一步细化。实际上，根据最高人民法院的裁判观点及司法实践，建设工程施工合同纠纷通常按照一般合同纠纷的管辖原则处理，即由被告住所地或合同履行地人民法院管辖，除非双方有特别约定。
二、实际管辖原则
一般合同纠纷管辖原则：
- 建设工程施工合同纠纷作为合同纠纷的一种，其管辖应遵循《民事诉讼法》关于合同纠纷的一般规定，即由被告住所地或合同履行地人民法院管辖。这一原则适用于大多数不涉及专属管辖的合同纠纷。
特殊情况下的协议管辖：
- 如果双方当事人在建设工程施工合同中明确约定了管辖法院，且该约定不违反级别管辖和专属管辖的规定，则应按照约定确定管辖法院。这种协议管辖的方式体现了当事人意思自治的原则，有助于减少管辖权争议。
三、不涉及工程款决算问题的影响
- 建设工程施工合同纠纷不涉及工程款的决算问题，并不改变其作为合同纠纷的本质。无论是否涉及工程款决算，该类纠纷均基于施工合同的履行而产生，因此其管辖原则应保持一致。即，除非双方有特别约定或法律另有规定，否则应按照一般合同纠纷的管辖原则处理。
四、建议与风险提示
- 明确约定管辖法院：为避免管辖权争议，双方当事人在签订建设工程施工合同时，可以明确约定管辖法院。这种约定应具体、明确，并符合法律的规定。
- 注意法律变化：由于法律和司法解释可能会随着时间和实践的发展而发生变化，因此当事人在处理建设工程施工合同纠纷时，应及时关注最新的法律动态和司法实践。
- 寻求专业法律帮助：在处理复杂的建设工程施工合同纠纷时，建议当事人寻求专业律师的帮助。律师可以根据具体情况提供针对性的法律建议，帮助当事人更好地维护自身权益。
综上所述，建设工程施工合同纠纷不涉及工程款的决算问题，仍然不适用专属管辖。在处理此类纠纷时，应遵循一般合同纠纷的管辖原则或双方当事人的约定来确定管辖法院。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。