结论前置：关于病假休了两年，单位还让继续休息是否合法的问题，不能一概而论，需结合具体情况判断，包括病假的实际性质、医疗期是否已满、单位安排是否合理以及是否遵循了法定程序等。
详细分析：
医疗期与病假的关系：
- 医疗期是指企业职工因患病或非因工负伤停止工作治病休息不得解除劳动合同的时限。医疗期的长度根据职工的实际工作年限和在本单位的工作年限来确定，一般为三个月到二十四个月不等。
- 如果职工的医疗期尚未结束，且根据医疗机构的证明需要继续休息，那么单位让职工继续休息是合法的。
医疗期满后的处理：
- 如果职工的医疗期已经结束，但根据医疗机构的证明仍需要休息，此时单位不能单方面决定让职工继续休息而不支付工资或解除劳动合同。单位应与职工协商，看是否能够调整工作岗位或者安排其他适合的工作。
- 如果职工不能从事原工作，也不能从事由用人单位另行安排的工作的，单位可以提前三十日以书面形式通知职工本人或者额外支付职工一个月工资后，解除劳动合同，但需依法支付经济补偿。
单位安排的合理性：
- 即使职工的医疗期尚未结束，单位也不能无限制地让职工休息。单位应确保职工的休息是出于医疗需要，并且应定期与职工沟通，了解其恢复情况。
- 如果单位无正当理由让职工长期休息，且不支付工资或提供其他生活保障，可能构成违法。
法定程序与权益保障：
- 无论何种情况，单位在处理职工病假和休息问题时，都应遵循法定程序，如及时通知职工、提供必要的医疗证明、与职工协商等。
- 职工也有权了解自己的权益，如医疗期的长度、病假工资的支付标准等，并在必要时寻求法律援助。
法律建议：
- 如果您认为单位的安排不合理或侵犯了您的权益，您可以先与单位进行沟通，了解具体情况和原因。
- 如果沟通无果，您可以向当地的劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
可能后果：
- 如果单位违反了相关法律法规，如未支付病假工资、未遵循法定程序解除劳动合同等，可能面临劳动监察部门的处罚或劳动仲裁机构的裁决，需要支付赔偿金或恢复劳动关系等。
总之，病假休了两年，单位还让继续休息是否合法，需结合具体情况来判断。如果您对此有疑问或认为自己的权益受到了侵犯，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议。