诉讼费原告预交，调解后确认由被告负担的，法院通常会将诉讼费退给原告。以下从不同角度对此问题进行详细分析：

一、法律规定与操作流程

1. 法律规定：

   • 根据《诉讼费用交纳办法》的相关规定，诉讼费用由败诉方负担，胜诉方自愿承担的除外。在调解结案的情况下，诉讼费用的负担由双方当事人协商解决；协商不成的，由人民法院决定。
   • 当法院在调解书中明确诉讼费由被告承担时，原告预交的诉讼费在案件生效后，有权向法院申请退还不应负担的部分。

2. 操作流程：

   • 原告在收到调解书并确认诉讼费由被告承担后，应向法院提交退费申请，明确申请人信息、案件案号、预交诉讼费金额等关键内容，并附上缴费凭证等相关证据材料。
   • 法院收到申请后会进行审查核实，主要核对申请人身份、缴费情况、判决结果与退费依据等是否相符。
   • 经审查无误后，法院财务部门会启动退费程序，通过转账方式将诉讼费退回到申请人提供的银行账户，或者通知申请人到法院财务窗口直接领取退款。

二、实践中的特殊情况

1. 被告直接支付给原告：

   • 虽然实践中存在被告在执行阶段直接将诉讼费支付给原告的情况，但这并非法定普遍方式。如果双方协商一致，且法院认可这种支付方式，那么也是可行的。但通常情况下，法院会按照法定程序进行退费。

2. 退费时间与效率：

   • 退费时间可能因法院工作繁忙、流程复杂等因素而有所延迟。原告在提交退费申请后，应耐心等待法院的处理结果。如果长时间未收到退款，可以及时向法院咨询退费进度。

三、法律建议与风险提示

1. 及时申请退费：

   • 原告在收到调解书并确认诉讼费由被告承担后，应及时向法院提交退费申请，以免错过退费时机。

2. 保留相关证据：

   • 原告在申请退费时，应保留好缴费凭证、调解书等相关证据材料，以便法院进行审查核实。

3. 关注退费进度：

   • 原告在提交退费申请后，应关注退费进度，及时与法院沟通联系，确保退费程序顺利进行。

4. 遵守法律规定：

   • 双方当事人在处理诉讼费问题时，应遵守法律规定和法院的决定，不得擅自改变诉讼费的承担方式或金额。