农民工工资专户支付材料费不合法。下面我对此进行详细分析：

一. 农民工工资专户的定义与用途

1. 定义：农民工工资专户是指施工总承包单位在银行业金融机构开立的，专项用于支付农民工工资的专用存款账户。
2. 用途：该账户的主要功能是确保农民工工资能够按时、足额发放，避免拖欠农民工工资的情况发生。根据《工程建设领域农民工工资专用账户管理暂行办法》第三条，专用账户仅用于支付投诉维权、为农民工提供法律服务等相关费用，以及支付人工费用。这里的“人工费用”特指农民工的工资，不包括其他费用。

二. 支付材料费的合法性分析

1. 不符合专户用途：如上所述，农民工工资专户的主要用途是支付农民工的工资，而非材料费。将专户资金用于支付材料费，显然违背了专户的设立初衷和用途。
2. 可能构成违法行为：如果施工总承包单位将农民工工资专户的资金用于支付材料费，可能构成挪用专项资金的行为，这不仅违反了相关法律法规，还可能损害农民工的合法权益。

三. 相关法律依据

• 《工程建设领域农民工工资专用账户管理暂行办法》第三条明确规定，专用账户仅用于支付投诉维权、法律服务等相关费用以及农民工工资，不得挪作他用。

综上所述，农民工工资专户支付材料费是不合法的。施工总承包单位应严格按照相关法律法规和专用账户的管理规定，确保专户资金专款专用，切实保障农民工的合法权益。如有进一步需要，您可以继续咨询我。