关于结算时扣除规费，国家是否有规定的问题，结论是：国家确实有相关规定，但具体是否扣除及扣除比例需依据合同约定、行业规定及地方性法规综合判断。以下从不同角度为您详细分析：

1. 合同约定优先

在合同纠纷中，合同是双方权利义务的基础。若合同中明确约定了结算时可以扣除规费，且该约定不违反法律、行政法规的强制性规定，那么按照合同约定执行是合法的。例如，在建设工程合同中，双方可能约定从工程款中扣除一定比例的规费作为管理费用。这种情况下，扣除规费是有合同依据的。

2. 行业规定与惯例

除了合同约定外，某些行业可能存在特定的规费扣除规定或惯例。这些规定或惯例可能由行业协会制定，或者在该行业内被广泛接受。例如，在物流行业，可能存在按照货物重量或体积计算规费，并在结算时扣除的惯例。然而，需要注意的是，行业规定或惯例不能违反法律、行政法规的强制性规定，否则将被视为无效。

3. 地方性法规与政策

在某些情况下，地方性法规或政策也可能对规费的扣除作出规定。例如，某些地区可能为了鼓励特定行业的发展，出台政策允许在结算时扣除一定比例的规费作为税收优惠或补贴。这种情况下，扣除规费是有地方性法规或政策依据的。但同样，这些规定不能违反上位法（如法律、行政法规）的强制性规定。

4. 法律原则与公平性

即使合同、行业规定或地方性法规允许扣除规费，也需要考虑法律原则和公平性。例如，如果扣除的规费比例过高，导致一方当事人的利益严重受损，那么这种扣除可能被视为不公平，从而引发合同纠纷。在这种情况下，法院或仲裁机构可能会根据公平原则对规费的扣除进行调整。

5. 实际操作建议

• 审查合同：在结算前，务必仔细审查合同条款，确保对规费的扣除有明确的约定。
• 了解行业规定：如果所在行业有特定的规费扣除规定或惯例，需要了解并遵守这些规定。
• 关注地方性法规：如果所在地区有关于规费扣除的地方性法规或政策，需要关注并遵守这些规定。
• 协商与调解：如果双方对规费的扣除存在争议，可以尝试通过协商或调解的方式解决。
• 法律途径：如果协商或调解无果，可以考虑通过法律途径（如诉讼或仲裁）解决争议。

总结：结算时扣除规费是否有国家规定，需结合合同约定、行业规定、地方性法规及法律原则综合判断。在实际操作中，建议双方明确约定规费的扣除方式和比例，并遵守相关法律法规和行业规定，以避免不必要的合同纠纷。如果您在结算过程中遇到规费扣除的问题，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议。