关于总价合同中未做项目是否要扣减以及规费如何计算的问题，以下是我的详细解答：
一、总价合同中未做项目是否要扣减
合同有明确约定时：
- 如果合同中明确规定了未实施的项目需从合同总价中扣除，那么应严格按照合同约定执行。例如，合同中可能写明“未实际施工的项目，结算时按预算金额扣除”，在这种情况下，未做的项目价款必须从总价中扣除。
- 反之，如果合同约定无论实际工程量如何变化，合同总价都不予调整，那么除非合同另有特别规定，否则未做的项目通常不需要从总价中扣除。
合同无明确约定时：
- 当合同中没有明确约定未做项目是否需要扣除时，双方应首先尝试通过协商达成补充协议。在协商过程中，应充分考虑项目的实际情况、市场行情、交易习惯等因素。
- 若无法达成补充协议，则可依据《中华人民共和国民法典》的相关规定，按照合同相关条款、交易习惯或市场价格来确定处理方式。这可能涉及到对未做项目价值的评估，以及考虑扣除后对项目整体的影响。
变更情况的处理：
- 如果是发包人要求取消项目导致未实施，那么一般应从合同总价中减掉该项目价款，并且承包人可能还有权主张因项目取消造成的其他损失赔偿。
- 若因承包人自身原因导致项目未做，是否扣除价款需看合同具体约定。有些合同会规定承包人违约的处理方式，可能包括扣除价款和承担违约责任；而有些合同则可能不因承包人原因而调整总价。
项目性质及关联性的考虑：
- 如果未做的项目是独立的、与其他项目关联性不强且价值清晰可算，那么通常应当从合同总价中扣除该项目价款。
- 若未做的项目与整体项目关联性紧密，难以单独区分其价值，并且扣除可能会影响项目的完整性或功能性，则需要综合考虑多种因素，甚至可能需要专业评估或协商、诉讼等方式来解决。
二、规费的计算
规费通常是根据国家或地方的相关规定来计算的，它可能包括工程排污费、社会保障费、住房公积金等。在总价合同中，规费的计算一般遵循以下原则：
按照合同约定计算：
- 如果合同中明确规定了规费的计算方式和标准，那么应严格按照合同约定来计算。
按照实际发生计算：
- 如果合同中没有明确规定规费的计算方式，或者规定按照实际发生来计算，那么应根据实际发生的规费项目和金额来计算。这可能需要承包人提供相关的发票或证明文件。
考虑变更情况：
- 如果合同履行过程中发生了变更，导致规费项目或金额发生变化，那么应根据变更情况来调整规费的计算。这可能需要双方协商或依据相关法律规定来确定。
在实际操作中，我建议：
- 双方在签订合同时就明确约定未做项目的处理方式以及规费的计算方式和标准，以避免后续纠纷。
- 在合同履行过程中，双方应保持充分沟通，及时协商解决出现的问题。
- 如果遇到复杂或争议较大的问题，建议及时咨询专业律师或相关机构以获取更准确的法律意见。
希望以上解答能对你有所帮助。如果你还有其他问题或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。