若总包不服从管理，甲方可以采取以下措施来维护自身权益和项目的正常进行：
沟通与协商：
- 甲方首先应尝试与总包进行沟通，明确指出其不服从管理的行为及其可能带来的不良影响，如工期延误、质量不达标等。
- 要求总包立即改正其不当行为，并强调双方合作的基础是相互尊重和遵守合同约定。
依据合同条款处理：
- 甲方应仔细审查与总包签订的施工合同，查看其中对于总包不服从管理情况的约定条款。
- 根据合同条款，甲方可以要求总包承担违约责任，如支付违约金、赔偿损失等。
- 若合同中有明确规定，甲方还可以采取扣除相应工程款、暂停支付工程款等措施。
发出书面整改通知：
- 若沟通无果，甲方应向总包发出书面整改通知，明确指出其不服从管理的具体行为、整改要求以及整改期限。
- 整改通知中应明确未整改或整改不到位的后果，如解除合同、追究法律责任等。
采取法律手段：
- 若总包仍拒不改正，甲方可以根据合同约定和相关法律法规，向法院提起诉讼或申请仲裁，要求总包承担法律责任。
- 在诉讼或仲裁过程中，甲方应提供充分的证据证明总包的不服从管理行为及其造成的损失。
考虑解除合同：
- 若总包的不服从管理行为严重影响了项目的正常进行，且无法通过其他方式解决，甲方可以考虑解除与总包的合同。
- 解除合同前，甲方应确保已按照合同约定和法律法规的要求，履行了通知、协商等义务。
- 解除合同后，甲方可以寻求新的合作伙伴，以确保项目的顺利进行。
在处理总包不服从管理的问题时，甲方还需注意以下几点：
- 保留证据：甲方应妥善保留与总包沟通、协商的记录，以及总包不服从管理的相关证据，如照片、视频、邮件等。这些证据在后续的法律纠纷中可能起到关键作用。
- 遵循法律程序：甲方在采取任何措施时，都应遵循法律法规的要求，确保自身行为的合法性。避免因采取不当措施而引发新的法律纠纷。
- 考虑项目整体利益：在处理总包不服从管理的问题时，甲方应综合考虑项目的整体利益，避免因处理不当而对项目造成更大的损失。
若甲方在处理过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。我将根据您的具体情况，提供专业、全面的法律服务。