公司可以在一定条件下对未在指定区域吸烟的员工进行处罚。针对这一问题，我们可以从以下几个方面进行分析：

一. 公司规章制度的规定

1. 公司规章制度的重要性：公司规章制度是公司内部管理的重要依据，它规定了员工的行为规范和公司的管理要求。如果公司在其规章制度中明确规定了吸烟区域，并要求员工必须在指定区域吸烟，那么员工应当遵守这一规定。
2. 规章制度的约束力：一旦员工违反了公司规章制度中的相关规定，公司有权根据规章制度的约定对员工进行相应的处罚。这种处罚可以是警告、罚款、甚至解除劳动合同等，具体取决于规章制度的约定和违规行为的严重程度。

二. 法律法规的支持

1. 《中华人民共和国劳动法》的相关规定：虽然《劳动法》并未直接规定员工吸烟的具体管理要求，但它赋予了用人单位制定规章制度并管理员工的权利。只要用人单位的规章制度不违反法律法规的强制性规定，且经过民主程序制定并公示，就对员工具有约束力。
2. 其他相关法律法规：除《劳动法》外，其他相关法律法规也可能对用人单位的管理权进行规定，但同样没有直接涉及员工吸烟的管理。因此，在这一问题上，主要依据的是公司规章制度和劳动合同中的约定。

三. 实际操作的建议

1. 明确规章制度：公司应确保其规章制度中明确规定了吸烟区域和违规吸烟的处罚措施，以便在员工违规时有据可依。
2. 加强宣传教育：公司可以通过宣传教育、张贴告示等方式，提高员工对吸烟区域规定的认识，引导员工自觉遵守。
3. 合理处罚：在处罚违规吸烟的员工时，公司应确保处罚措施合理、公正，避免引发不必要的劳动争议。

综上所述，如果公司在其规章制度中明确规定了吸烟区域，并要求员工必须在指定区域吸烟，那么员工未在指定区域吸烟的行为就构成了违规，公司可以根据规章制度的约定对员工进行处罚。我的观点是，公司在处理这类问题时，应确保规章制度的合法性和合理性，并加强员工的宣传教育和引导。如有进一步需要，您可以继续咨询我。