综合工时制下，加班费通常按照不低于劳动者本人小时工资标准的150%计算延长工作时间的加班费，法定节假日工作的则按不低于劳动合同规定的劳动者本人日或小时工资标准的300%支付加班费，不存在单纯因“休息日”上班就支付2倍加班费的情况。以下是对此问题的详细分析：

一、综合工时制概述

综合计算工时工作制是一种特殊的工作时间安排制度，它适用于因工作性质特殊或受自然条件限制，需连续作业且难以按照标准工作时间进行工作的岗位。该制度以周、月、季、年为周期综合计算工作时间，某一具体日（或周）的实际工作时间可以超过8小时（或40小时），但综合计算周期内的总实际工作时间不应超过总法定标准工作时间。

二、加班费计算原则

1. 延长工作时间加班：

   • 在综合计算周期内，如果劳动者的总实际工作时间超过总法定标准工作时间，那么超出的部分应被视为延长工作时间。根据相关规定，这部分时间应按照不低于劳动者本人小时工资标准的150%支付加班费。
   • 计算公式：\(加班工资 = 月工资 \div 21.75 \div 8 \times 加班小时数 \times 1.5\)。

2. 法定节假日加班：

   • 无论采用何种工时制度，法定节假日安排劳动者工作的，都应按照不低于劳动合同规定的劳动者本人日或小时工资标准的300%支付加班费。
   • 计算公式：\(法定节假日加班工资 = 月工资 \div 21.75 \div 8 \times 加班小时数 \times 3\)。

三、关于“休息日”加班的特殊说明

• 在综合工时制下，不存在像标准工时制那样单纯因为是“休息日”上班就支付2倍加班费的情况。因为综合工时制已经对工作时间进行了周期性综合计算，不再严格区分工作日和休息日。
• 部分地区可能有特别规定，但通常也是基于综合计算周期内的工作时间是否超出法定标准来决定是否支付加班费及支付的标准，而非单纯基于是否在“休息日”工作。

四、综合考虑因素

• 除了上述一般原则外，还需考虑地区性法规、行业规定以及劳动合同中的特定约定。这些都可能对综合工时制下的加班费计算产生影响。
• 如果劳动合同中有明确的加班费计算方式，且该方式不违反法律法规的强制性规定，则应优先按照劳动合同的约定执行。

五、建议与注意事项

• 了解地区性法规：不同地区可能对综合工时制下的加班费计算有具体规定，建议劳动者和用人单位都了解并遵守当地的相关法规。
• 明确劳动合同约定：在签订劳动合同时，应明确加班费的计算方式和标准，以避免后续纠纷。
• 保留相关证据：劳动者应保留好与加班相关的证据，如加班记录、工资条等，以便在发生纠纷时维护自己的合法权益。

在实际操作中，如果劳动者对综合工时制下的加班费计算有疑问或争议，建议直接向我咨询，以确保合法合规地处理加班费问题。