核心结论：若用人单位没有工商登记，而是挂靠在另外公司，劳动者在申请劳动仲裁时，需根据实际情况确定被申请人，并准备充分的证据材料。

具体分析：

1. 确定被申请人：

   • 若挂靠关系明确：即实际用人单位与挂靠公司之间有明确的挂靠协议，且劳动者知晓并接受这种挂靠关系，那么在申请劳动仲裁时，可以将挂靠公司（即名义上的用人单位）和实际用人单位（未进行工商登记的单位）列为共同被申请人。但需注意，由于实际用人单位未进行工商登记，可能无法直接承担法律责任，此时挂靠公司可能需承担连带责任。
   • 若挂靠关系不明确或劳动者不知情：劳动者可能仅知晓与挂靠公司存在劳动关系，而对实际用人单位并不知情。在这种情况下，劳动者可以仅将挂靠公司列为被申请人。但若后续发现实际用人单位与案件有关，且挂靠公司无法完全承担责任时，可能需要追加实际用人单位（或其负责人）为被申请人，尽管其未进行工商登记。

2. 准备证据材料：

   • 无论选择哪种方式确定被申请人，劳动者都需要准备充分的证据材料来证明其与用人单位（无论是挂靠公司还是实际用人单位）之间存在劳动关系，以及用人单位存在的违法行为（如未支付工资、未缴纳社保等）。
   • 证据材料可能包括：劳动合同、工资条、银行转账记录、工作证、考勤记录、同事证言等。

3. 申请劳动仲裁的流程：

   • 劳动者应向有管辖权的劳动争议仲裁委员会提交仲裁申请书，并附上相关证据材料。
   • 仲裁委员会在收到申请后，会进行审查，并决定是否受理。
   • 若受理，仲裁委员会将组织双方进行调解或开庭审理，并作出裁决。

特别提醒：

• 由于实际用人单位未进行工商登记，可能存在逃避法律责任的风险。因此，劳动者在申请劳动仲裁时，应尽可能收集并保留与实际用人单位相关的证据，以便在必要时追究其法律责任。
• 若对仲裁结果不服，劳动者还可以在法定期限内向人民法院提起诉讼。

建议：

• 在处理此类劳动争议时，建议劳动者咨询专业律师（即向我咨询），以便更准确地确定被申请人、准备证据材料，并了解整个仲裁流程。
• 同时，劳动者也应保持冷静和理性，通过合法途径维护自己的权益。