事业单位不打卡但是上班了，通常不应被认定为旷工。下面我将从几个方面详细解释这一观点：
一、打卡制度的目的与功能
打卡制度主要是为了记录员工的上下班时间，便于单位进行考勤管理。然而，它并不能全面反映员工的工作状态和实际工作情况。忘记打卡或因特殊原因未打卡，并不等同于未出勤或未提供劳动。员工可能因各种原因（如疏忽、设备故障等）未能打卡，但这并不意味着他们未履行工作职责。
二、劳动权利与义务
根据《中华人民共和国劳动法》的相关规定，劳动者享有取得劳动报酬的权利。只要员工提供了正常劳动，就有权获得相应的报酬。事业单位不应因员工未打卡而剥夺其获得报酬的权利，除非有确凿证据证明员工确实未出勤或未提供劳动。
三、实际操作与建议
沟通与说明：如果员工因特殊原因未打卡但正常出勤，建议及时与单位管理层或人力资源部门进行沟通，说明情况并提供相关证据（如同事证言、工作记录等），以避免被误判为旷工。
完善考勤制度：事业单位也应完善考勤制度，明确忘记打卡或未打卡的处理方式。例如，可以允许员工在一定时间内补打卡或提交出勤证明等，以体现人性化管理并保障员工的合法权益。
法律后果：如果单位仅凭未打卡就认定员工旷工，并据此进行处罚（如扣发工资、解除劳动合同等），员工有权通过法律途径维护自己的权益。根据相关法律法规，单位需要承担举证责任，证明员工确实存在旷工行为。如果单位无法提供充分证据，其处罚决定可能会被认定为违法。
四、特殊情况下的处理
当然，也存在一些特殊情况。例如，如果单位有明确的规章制度规定未打卡即视为旷工，并且该规章制度已经过民主程序制定并公示给员工，那么在这种情况下，员工未打卡可能会被认定为旷工。但是，即使如此，单位也需要确保规章制度的合法性和合理性，并且不能违反相关法律法规的规定。
建议：事业单位在处理未打卡但正常出勤的情况时，应秉持公平、公正、合理的原则，充分考虑员工的实际情况和权益。如果员工遇到此类问题，可以及时与单位沟通并寻求法律帮助。如果有任何法律疑问或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。