老板将已发放的奖金从工资中扣除是否违法，需视具体情况而定。以下是从不同角度进行的分析：

一、若奖金发放有明确约定且员工满足条件

1. 劳动合同或公司规定明确：如果劳动合同或公司内部规章制度中明确规定了奖金的发放条件、标准和方式，并且员工已经满足了这些条件，那么老板无理由地擅自扣除奖金就可能构成违法行为。
2. 法律后果：在这种情况下，员工有权要求老板按照约定支付奖金。如果老板拒绝支付，员工可以向劳动监察部门投诉或者提出劳动仲裁申请，以维护自己的合法权益。

二、若员工违反公司规定或存在工作失误

1. 公司规定合法有效：如果员工违反了公司已公布并符合法律法规的规定，比如产生工作失误、违背劳动纪律等状况，公司有权根据规定扣除相应的奖金。
2. 扣除的合理性：然而，即使在这种情况下，公司扣除奖金也应当遵循合理、公正的原则，不能随意扣除或超额扣除。如果员工认为扣除的奖金不合理，也可以向劳动监察部门投诉或提出劳动仲裁申请。

三、建议与行动步骤

1. 核实规定：首先，建议您核实清楚劳动合同和公司规章制度中的奖金规定，确保自己了解奖金的发放条件和标准。
2. 准备证明材料：同时，准备充分的相关证明材料，如考勤记录、绩效评价等，以证明自己是否满足了奖金的发放条件。
3. 与老板沟通：如果发现老板擅自扣除了奖金，您可以先尝试与老板进行沟通，了解扣除的原因和依据，并表达自己的诉求。
4. 投诉或仲裁：如果沟通无果，您可以向劳动监察部门投诉或者提出劳动仲裁申请，以维护自己的合法权益。

举例说明：假设您与公司签订的劳动合同中明确规定了年终奖金的发放条件为全年无迟到、早退和旷工记录，并且您满足了这一条件。然而，在发放奖金后，老板却以您某次工作失误为由扣除了部分奖金。在这种情况下，老板的行为就可能构成违法，因为您已经满足了劳动合同中规定的奖金发放条件。

最后提醒：在处理此类问题时，请务必保持冷静和理性，通过合法途径维护自己的权益。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。