在行政复议中，行政机关对申请人提出的证据不作回复，主要违反了《中华人民共和国行政复议法》的相关规定。以下是对此问题的详细分析：
一、直接违反的法律条款
- 《中华人民共和国行政复议法》的相关规定：
- 根据该法，行政机关在收到行政复议申请后，有义务在法定期限内提出书面答复，并提交当初作出具体行政行为的证据、依据和其他有关材料。若行政机关未履行此义务，即构成对申请人证据的不作回复，违反了法律规定。
二、可能引发的法律后果
视为无证据、依据并撤销具体行政行为：
- 若行政机关未在规定时间内提出书面答复或提交相关证据、依据，行政复议机关将直接视为该具体行政行为没有证据、依据，并可能决定撤销该具体行政行为。
对责任人员的处罚：
- 对于直接负责的主管人员和其他直接责任人员，行政复议机关可以依法给予警告、记过、记大过的行政处分。若经责令履行仍拒不履行，则可进一步给予降级、撤职、开除的严厉处分。
三、对申请人的影响及建议
影响：
- 行政机关对申请人证据的不作回复，可能导致申请人的合法权益无法得到及时、有效的保护。同时，这也可能损害行政复议制度的权威性和公正性。
建议：
- 及时沟通：申请人可以尝试与行政机关进行沟通，了解其未作回复的具体原因，并要求其尽快履行义务。
- 申请行政复议或提起行政诉讼：若沟通无果，申请人可以向行政复议机关申请行政复议，或直接向人民法院提起行政诉讼，以维护自己的合法权益。
- 寻求法律援助：在整个过程中，申请人可以寻求专业律师的法律咨询和援助，以确保自己的权利得到充分保护。
四、实际操作中的注意事项
保留证据：
- 申请人应妥善保留自己提出的证据材料，以及行政机关未作回复的相关证据，如邮寄凭证、电子邮件等。
遵循法定程序：
- 申请人在申请行政复议或提起行政诉讼时，应严格遵循法定程序和要求，确保自己的申请或起诉符合法律规定。
总结来看，行政机关在行政复议中对申请人提出的证据不作回复，不仅违反了《中华人民共和国行政复议法》的相关规定，还可能引发一系列不利的法律后果。因此，行政机关应严格遵守法律规定，积极履行其在行政复议中的义务和责任。同时，申请人也应了解自己的权利，并在必要时采取法律手段维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。