工厂拆迁补偿直接给房东是否合法，需分情况讨论：
若工厂产权归房东所有
- 根据《国有土地上房屋征收与补偿条例》及相关法律规定，拆迁补偿款通常应发放给被拆迁房屋的所有权人，即房东。这是因为房东对房屋享有合法的所有权，有权获得相应的拆迁补偿。
- 例外情形：若工厂实际使用人（如承租人）与房东在租赁合同中明确约定了拆迁补偿的分配方式，且该约定不违反法律法规的强制性规定，则应按照合同约定执行。例如，合同中可能约定承租人有权获得部分拆迁补偿，以弥补其因拆迁而遭受的损失。
若工厂产权归承租人所有，或承租人享有部分产权
- 在这种情况下，拆迁补偿款不应直接全部发放给房东。承租人作为房屋的实际使用人或部分产权人，有权获得与其产权或使用权相对应的拆迁补偿。
- 处理方式：房东与承租人应协商确定拆迁补偿的分配方案。若协商不成，可通过法律途径解决，如提起民事诉讼，由法院根据双方的实际贡献、损失情况等因素，判决拆迁补偿款的分配比例。
若工厂存在违法建筑或超期临时建筑
- 对于违法建筑或超期临时建筑，根据现行法律法规，通常不予拆迁补偿。因此，无论房东还是承租人，都无法获得这部分建筑的拆迁补偿。
- 特殊情况：若违法建筑或超期临时建筑在拆迁前已被相关部门认定为可补办手续或可给予一定补偿的，则应按照相关规定执行。但这种情况较为少见，且需满足严格的条件。
法律建议：
- 在工厂拆迁前，房东与承租人应仔细审查租赁合同，明确双方在拆迁补偿方面的权利和义务。
- 若合同中未明确约定或约定不明确，双方应协商确定拆迁补偿的分配方案，并签订书面协议以避免后续纠纷。
- 若协商不成或发生纠纷，建议及时咨询专业律师，通过法律途径解决争议。
可能后果：
- 若拆迁补偿款直接发放给房东，而承租人对此有异议且未通过合法途径解决，承租人可能面临无法获得应有补偿的风险。
- 反之，若承租人擅自占有拆迁补偿款，而房东对此有异议，房东同样可能通过法律途径要求承租人返还不当得利。
因此，在工厂拆迁过程中，房东与承租人应保持沟通，依法依规处理拆迁补偿事宜，以维护双方的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。