针对您提出的“员工主要责任被车撞了怎么赔偿”的问题，这确实是一个涉及交通事故赔偿与工伤赔偿的复杂情况。以下是我为您提供的详细解答：

一、交通事故赔偿方面

1. 责任认定：

   • 首先，需要由交警部门对事故进行定责。若员工在事故中负主要责任，那么对方（即非员工方）的责任会相对较小。但即便如此，对方仍可能需承担一定的赔偿责任，具体取决于事故的具体情况和责任划分。

2. 赔偿项目：

   • 赔偿项目通常包括医疗费、误工费、护理费、交通费等。若事故造成残疾，还有残疾赔偿金等。
   • 医疗费：根据实际诊疗支出确定。
   • 误工费：按照员工的误工时间和收入状况计算。误工时间根据医院证明等确定，收入按实际减少的计算。
   • 护理费：护理人员有收入的按误工费计算，无收入或雇佣护工的参照当地护工从事同等级别护理的劳务报酬标准计算。
   • 交通费：根据实际就医等发生的费用计算。
   • 残疾赔偿金：若构成伤残，根据伤残等级、受诉法院所在地上一年度城镇居民人均可支配收入或者农村居民人均纯收入标准等计算。

3. 赔偿顺序：

   • 若对方有责（即使员工负主责），先由对方车辆的交强险在责任限额内赔偿。
   • 不足部分，按责任比例由商业险或侵权人（即对方）承担。由于员工负主责，因此对方承担的比例会相对较小。

二、工伤赔偿方面

1. 工伤认定：

   • 根据《工伤保险条例》，职工在上下班途中，若受到非本人主要责任的交通事故伤害，应当认定为工伤。但在此情况下，由于员工负主责，因此可能不符合工伤认定的条件。然而，具体还需根据当地社保部门的规定和实际情况进行判断。
   • 若员工被认定为工伤，则可享受工伤保险待遇，包括医疗费、停工留薪期工资、伤残津贴等。

2. 单位责任：

   • 若单位未为员工缴纳工伤保险，则单位需承担相应的赔偿责任。

三、赔偿流程与建议

1. 及时报警与收集证据：

   • 事故发生后，应立即报警并由交警出具事故责任认定书，明确责任划分。
   • 同时，收集相关证据，如事故认定书、病历、发票等，以便后续赔偿。

2. 与责任方和保险公司协商：

   • 根据责任划分，与责任方（即对方）及其保险公司协商赔偿事宜。
   • 若协商不成，可考虑通过民事诉讼解决。

3. 关注工伤认定与赔偿：

   • 若员工可能符合工伤认定条件，单位应及时向统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。
   • 若被认定为工伤，则可享受工伤保险待遇。

4. 保留证据与票据：

   • 在整个赔偿过程中，务必保留好各类票据、诊断证明等相关证据，以便顺利获得赔偿。

总结：员工在事故中负主要责任时，交通事故赔偿方面主要由对方（在责任范围内）和员工自身（通过可能的商业保险或自费）承担。工伤赔偿方面则取决于是否符合工伤认定条件。建议及时报警、收集证据、与责任方和保险公司协商，并关注工伤认定与赔偿的可能性。如有需要，可寻求专业法律人士的帮助。