针对您提出的“层层分包农民工工资亏损怎么办”的问题，这是一个涉及建设工程领域中农民工工资支付的重要议题。以下是我为您提供的详细解答：
首先，需要明确的是，根据《保障农民工工资支付条例》的相关规定，分包单位对所招用农民工的实名制管理和工资支付负有直接责任。然而，当分包单位因亏损等原因导致工程款不足以支付农民工工资时，农民工并非无处可寻帮助。
一、总承包单位的责任
先行清偿义务：根据条例，施工总承包单位对分包单位劳动用工和工资发放等情况进行监督。当分包单位拖欠农民工工资时，施工总承包单位有义务先行清偿，再依法进行追偿。这意味着，即使分包单位亏损，农民工也有权向总承包单位追讨工资。
监督职责：建筑施工总承包单位必须严格落实条例的有关规定，积极履行对分包单位有关劳动用工和工资发放情况的监督职责。这有助于从根源上减少农民工欠薪问题的发生。
二、分包单位的处理
有资质的分包单位：如果分包单位具有相应资质，农民工可以先尝试与分包单位协商，要求其筹集资金支付工资。如果协商无果，农民工可以通过法律途径追讨工资。
无资质的分包单位：如果分包单位无资质，那么总承包单位需要承担清偿责任。这是因为总承包单位在选择分包单位时，有义务确保其具备相应的资质和能力。
三、建设单位的责任
在特定情况下，建设单位也可能需要承担一定的责任。例如，如果建设单位未结清工程款，且该款项足以支付农民工工资，那么建设单位可能需要在未结清的工程款范围内先行垫付工资。
四、维权途径
向劳动监察部门投诉：农民工可以向当地劳动监察部门投诉，劳动监察部门有权责令相关单位支付工资。这是快速解决欠薪问题的一种有效方式。
申请劳动仲裁或起诉：如果问题仍未得到解决，农民工可以依法申请劳动仲裁或向法院起诉。通过法律途径维护自己的合法权益。
五、实际案例参考
以小朱等农民工的案例为例，他们受雇于分包单位参与某工程建设。工程结束后，分包单位因亏损导致工程款不足以支付工资。在这种情况下，小朱等人有权向总承包单位主张清偿工资。如果分包单位有资质，他们可以先尝试与分包单位协商；如果协商无果，可以通过法律途径追讨。如果分包单位无资质，总承包单位则需要承担清偿责任。
综上所述，当层层分包导致农民工工资亏损时，农民工可以通过向总承包单位追讨、与分包单位协商、向劳动监察部门投诉以及申请劳动仲裁或起诉等途径来维护自己的合法权益。希望这些解答能够对您有所帮助。