若别人未经你公司同意，擅自使用你公司承包的工程，你公司一般有权要求对方支付费用，但具体需视情况而定。以下从不同角度为你详细分析：
一、从合同角度分析
若存在有效合同且对方违约：
- 如果你公司已经与发包方签订了工程承包合同，并且合同中明确规定了工程的承包范围、使用权限等条款，而别人未经你公司同意擅自使用该工程，那么这很可能构成违约行为。
- 在此情况下，你公司有权依据合同条款要求对方停止侵权行为，并可能要求对方支付因违约而给你公司造成的损失，包括但不限于预期利益损失、维权费用等。
若不存在有效合同或合同未约定：
- 如果你公司尚未与发包方签订工程承包合同，或者合同中并未明确规定工程的承包范围、使用权限等条款，那么情况就会相对复杂。
- 在此情况下，你公司可能需要先通过协商、调解等方式与对方沟通，明确工程的使用权限和费用问题。如果协商无果，你公司可能需要考虑通过法律途径解决争议，如提起诉讼或申请仲裁。
二、从侵权角度分析
若构成侵权：
- 无论是否存在有效合同，如果别人未经你公司同意擅自使用你公司承包的工程，并且这种使用行为给你公司造成了损失（如名誉损失、经济损失等），那么这很可能构成侵权行为。
- 在此情况下，你公司有权依据《中华人民共和国民法典》中关于侵权责任的规定，要求对方承担侵权责任，包括停止侵权行为、赔偿损失等。
若不构成侵权：
- 如果别人的使用行为并未给你公司造成实际损失，或者这种使用行为属于合理使用范畴（如为了公共利益而进行的必要使用），那么可能不构成侵权行为。
- 在此情况下，你公司可能无法直接要求对方支付费用，但可以通过协商等方式与对方就工程的使用问题进行沟通。
三、实际操作建议
收集证据：
- 无论选择哪种途径解决争议，你公司都需要先收集相关证据，如工程承包合同、对方使用工程的证据（如照片、视频等）、给你公司造成损失的证据等。
协商解决：
- 在收集到足够证据后，你公司可以尝试与对方进行协商，明确工程的使用权限和费用问题。如果协商成功，可以签订书面协议以避免后续纠纷。
法律途径：
- 如果协商无果，你公司可以考虑通过法律途径解决争议。在此过程中，你公司需要委托专业律师进行代理，以确保自身权益得到充分保障。
举例说明：假设你公司承包了一项建筑工程，并与发包方签订了详细的工程承包合同。合同中明确规定了工程的承包范围、使用权限等条款。然而，在施工过程中，你公司发现另一家公司未经你公司同意擅自使用了该工程的一部分。在此情况下，你公司可以依据合同条款要求对方停止侵权行为，并可能要求对方支付因违约而给你公司造成的损失。如果对方拒绝配合，你公司可以通过法律途径解决争议。
如果有任何具体的法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。