甲方一般无权直接追究乙方公司员工职务侵占的责任，但可根据具体情况采取相应措施。以下是对此问题的详细分析：

一、职务侵占的责任主体

职务侵占罪是指公司、企业或者其他单位的工作人员，利用职务上的便利，将本单位财物非法占为己有，数额较大的行为。根据法律规定，职务侵占罪的责任主体是实施侵占行为的员工本人，而非其所在的公司或甲方。因此，从法律责任的角度来看，甲方无权直接追究乙方公司员工的职务侵占责任，这一责任应由司法机关依法追究。

二、甲方的权利与措施

尽管甲方无权直接追究乙方公司员工的职务侵占责任，但甲方在发现乙方公司员工存在职务侵占行为时，可以采取以下措施来维护自身权益：

1. 向乙方公司反映情况：

   • 甲方作为与乙方公司有业务往来的主体，在发现乙方公司员工存在职务侵占行为时，有权向乙方公司反映情况，并要求乙方公司进行调查和处理。
   • 乙方公司作为员工的用人单位，有责任对员工的违法行为进行调查，并根据调查结果采取相应的措施，如解除劳动合同、追究民事责任等。

2. 向公安机关报案：

   • 如果甲方认为乙方公司员工的职务侵占行为已经构成犯罪，且数额较大，甲方有权向公安机关报案，要求公安机关依法立案侦查。
   • 公安机关在接到报案后，会依法进行调查，并根据调查结果决定是否对涉案员工采取刑事强制措施。

3. 通过民事诉讼途径维护权益：

   • 如果甲方因乙方公司员工的职务侵占行为遭受了经济损失，甲方有权通过民事诉讼途径向乙方公司或涉案员工主张赔偿。
   • 在民事诉讼中，甲方需要提供充分的证据证明其经济损失与乙方公司员工的职务侵占行为之间存在因果关系。

三、特殊情况下的责任追究

在某些特殊情况下，如果甲方与乙方公司之间的合同或协议中明确约定了乙方公司对其员工职务侵占行为的责任承担方式，那么甲方可以根据合同或协议的约定向乙方公司主张责任。但这种情况下的责任追究是基于合同关系，而非直接对乙方公司员工的职务侵占行为进行追究。

四、建议与注意事项

1. 及时收集证据：

   • 甲方在发现乙方公司员工存在职务侵占行为时，应及时收集相关证据，如财务记录、交易凭证、证人证言等，以便在后续处理中提供有力的支持。

2. 谨慎处理与乙方公司的关系：

   • 甲方在处理与乙方公司员工职务侵占行为相关的问题时，应谨慎处理与乙方公司的关系，避免因处理不当而影响双方的业务合作。

3. 寻求专业法律帮助：

   • 如果甲方在处理此类问题时遇到法律难题或不确定如何操作，建议寻求专业律师的帮助，以确保自身权益得到妥善维护。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。