事业单位在编人员五年签一次的合同，通常是存入个人档案，而不是直接发放给本人保管。以下是从不同角度对此问题的详细分析：

一、合同存档的常规做法

在事业单位中，员工的劳动合同作为重要的法律文件，通常会被存入个人档案。这样做有几个原因：

1. 法律合规性：根据相关法律法规，用人单位有义务妥善保管员工的劳动合同，以备查验。存入个人档案是确保合同安全、完整的一种有效方式。
2. 管理便利性：将合同存入个人档案，便于单位在需要时快速查阅，如进行员工考核、晋升、调动等人事管理活动时。
3. 员工权益保障：个人档案中的劳动合同是员工权益的重要凭证。在发生劳动争议时，合同可以作为解决纠纷的重要依据。

二、合同发放给本人的情况

虽然合同通常存入个人档案，但在某些特殊情况下，单位可能会将合同副本发放给员工本人保管。这通常发生在以下情况：

1. 员工要求：如果员工出于个人原因（如方便查阅、备份等）强烈要求获得合同副本，单位在评估风险后可能会同意。
2. 单位政策：某些单位可能有明确的政策，规定在签订劳动合同后，将副本发放给员工本人。但这种情况相对较少，且通常会在单位内部规章制度中明确说明。

三、法律建议与注意事项

1. 确认合同存档方式：作为事业单位在编人员，您有权了解自己的劳动合同是如何存档的。如果单位未将合同存入个人档案，您可以向单位人事部门咨询并要求确认合同的存档方式。
2. 保留合同副本：即使合同存入个人档案，您也可以考虑自行保留一份合同副本。这样，在需要时您可以快速查阅合同内容，而无需依赖单位提供。
3. 关注合同条款：无论合同是存入个人档案还是发放给本人保管，您都应仔细阅读合同条款，确保自己的权益得到充分保障。如果发现合同中有不明确或不利于自己的条款，应及时与单位沟通并寻求法律帮助。

四、可能的法律后果

如果单位未按照法律法规的要求妥善保管员工的劳动合同，或者拒绝向员工提供合同副本（在员工合理要求的情况下），可能会面临以下法律后果：

1. 行政处罚：根据相关法律法规，用人单位如果未按照规定保管劳动合同或者拒绝提供劳动合同的，可能会受到劳动行政部门的处罚。
2. 劳动争议风险：在发生劳动争议时，如果单位无法提供有效的劳动合同作为证据，可能会承担不利的法律后果。

综上所述，事业单位在编人员五年签一次的合同通常是存入个人档案的。如果您对此有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。