关于监控下互殴导致脚部骨折轻伤二级，但受伤原因存疑时检察院是否会起诉的问题，结论前置如下：

1. 检察院可能会起诉：如果检察院认为现有证据足以证明犯罪行为的存在，即使受伤的具体原因存在一定疑问，也可能决定提起公诉。在司法实践中，证据的充分性和证明力是关键。监控录像作为直接证据，能够显示互殴的过程，而医疗鉴定确认了伤情为轻伤二级。这些证据结合起来，如果能够形成较为完整的证据链，证明被告人的行为与受害人的伤害结果之间存在因果关系，那么检察院很可能会提起公诉。

2. 检察院也可能不起诉：如果受伤原因的存疑导致证据链不完整，或者无法排除其他合理怀疑，检察院可能会作出不起诉决定。例如，如果监控录像无法清晰显示脚部骨折的具体成因，或者存在其他可能的致伤原因（如之前的事故、自伤等），且没有其他证据能够补强证明被告人的行为与伤害结果之间的直接联系，那么检察院可能会认为证据不足，从而决定不起诉。

法律背景与建议：

• 法律背景：根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，检察院在审查起诉阶段需要对案件的证据进行全面审查，确保证据的充分性和证明力。如果证据不足，不能证明被告人有罪，检察院应当作出不起诉决定。同时，对于存在疑问的证据，检察院需要谨慎处理，避免错误起诉。

• 法律建议：

  • 对于受害人：如果认为自己的权益受到了侵害，且现有证据能够支持自己的主张，可以积极向检察院提供证据，推动案件的起诉和审理。同时，也可以考虑寻求法律援助或聘请律师，以更好地维护自己的权益。
  • 对于被告人：如果认为自己被错误指控，或者受伤原因确实存在疑问，应当积极收集证据，证明自己的清白。在审查起诉阶段，可以向检察院提出自己的辩解和证据，争取不起诉决定。如果案件已经进入审判阶段，则应当在法庭上充分行使自己的辩护权利。

可能的法律后果：

• 如果检察院决定起诉，案件将进入审判阶段。在审判过程中，法院将对案件的证据进行全面审查，并根据事实和法律作出判决。如果被告人被认定有罪，将面临相应的刑事处罚。
• 如果检察院决定不起诉，案件将不会进入审判阶段。受害人如果认为不起诉决定有误，可以向上一级检察院申诉或直接向法院起诉。

进一步思考的依据：

在处理此类案件时，需要综合考虑证据的充分性、证明力以及案件的具体情况。受伤原因的存疑并不必然导致检察院不起诉，但确实会增加案件的复杂性和不确定性。因此，在处理此类案件时，建议当事人积极收集证据、寻求法律援助，并根据案件的具体情况制定合适的诉讼策略。

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