中专学历的乡村医生辞职是否构成违约以及是否会留档案，需分情况讨论：

1. 若未违反服务期约定或劳动合同条款，辞职一般不构成违约，不会因此留负面档案
   根据《劳动合同法》第三十七条，劳动者提前三十日以书面形式通知用人单位，可以解除劳动合同。若乡村医生与用人单位签订的劳动合同中未约定服务期（如未接受专项培训或未领取特殊补贴），或已履行完服务期义务，则正常辞职不构成违约，用人单位无权在档案中记录负面信息。

2. 若违反服务期约定或竞业限制条款，可能构成违约，但档案记录需符合法定程序

   • 服务期违约：根据《劳动合同法》第二十二条，若用人单位为乡村医生提供专项培训费用并约定服务期，医生未履行完服务期提前辞职，需按约定支付违约金。但违约金不得超过服务期未履行部分所应分摊的培训费用。此时，用人单位可能将违约事实记入档案，但记录内容需真实、合法，不得夸大或虚构。
     
   • 竞业限制违约：若劳动合同中约定竞业限制条款（如离职后一定期限内不得在同类机构从业），医生违反的，用人单位可要求其承担违约责任。但竞业限制条款仅适用于高级技术人员、管理人员或其他负有保密义务的人员，乡村医生是否适用需结合具体岗位判断。
     
   • 档案记录限制：根据《企业职工档案管理工作规定》，档案内容应真实反映员工工作表现，不得记录与事实不符或侵犯个人隐私的信息。用人单位若因违约将医生列入“黑名单”或记录不实信息，可能涉嫌违法。

3. 档案转移需依法进行，用人单位不得扣留档案
   根据《劳动合同法》第五十条，用人单位应在解除或终止劳动合同时出具证明，并在十五日内为劳动者办理档案和社会保险关系转移手续。若用人单位以“违约”为由扣留档案，乡村医生可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，要求强制转移档案。

建议：

• 辞职前核对劳动合同条款，确认是否涉及服务期、竞业限制等特殊约定；
  
• 若用人单位以违约为由要求支付高额违约金或扣留档案，可要求其提供法律依据，必要时通过法律途径维权；
  
• 档案记录影响未来就业，若发现不实信息，可要求用人单位更正或向劳动行政部门申诉。
  

如有具体合同条款或纠纷细节，可进一步提供信息以便针对性分析。