针对您提出的“历史遗留问题的违法用地怎么处理”这一问题，我会结合相关政策规定，为您详细解答。
首先，需要明确的是，历史遗留问题的违法用地处理是一个复杂且需要细致操作的过程，它通常涉及到规划、土地、建设等多个方面的法律法规。不同地区可能根据实际情况制定了具体的处理办法，以下我以深圳市龙华区的相关政策为例进行说明。
一、政策背景与依据
深圳市龙华区针对历史遗留的违法用地问题，制定了如《深圳市龙华区农村城市化历史遗留产业类和公共配套类违法建筑处理若干规定》以及《深圳市龙华区处理历史遗留生产经营性违法建筑实施办法》等政策文件。这些政策文件的出台，旨在进一步做好区内历史遗留违法建筑的处理工作，确保处理工作的合法性和严谨性。
二、处理原则与流程
确保政策前后有效衔接：在处理历史遗留违法用地时，会确保新政策与原有政策的有效衔接，避免因政策变动带来的不便。
确保职能部门分工合理：根据政府职能转变和行政体制改革的要求，明确各职能部门的分工和职责，确保处理工作的有序进行。
确保便于现实操作执行：结合实际情况，简化审批程序、缩短审批流程，使政策规定更加贴近现实需要。
三、具体处理措施
规划土地审查：对历史遗留的违法用地进行规划土地审查，根据审查结果予以现状确认或提出整改意见。
安全鉴定与消防验收：要求违法用地上的建筑物取得房屋安全鉴定报告及备案凭证、消防验收或备案凭证，以确保建筑物的安全性。
提交承诺书：申报人需与原农村集体经济组织或其继受单位出具承诺书，承诺遵守相关规定并承担相应责任。
会议审议与决策：对符合初审处理条件的历史违建，会召开街道办事处专题会议审议并出具初审意见。必要时，还会提交区政府分管领导办公会议审议。
简易处理程序：对于符合一定条件的历史违建，如尚未纳入城市更新单元计划但合法土地达到一定比例的，可以适用简易处理程序，简化处理流程。
四、注意事项
遵守法律法规：在处理历史遗留违法用地时，必须严格遵守相关法律法规，确保处理工作的合法性和合规性。
尊重历史事实：在处理过程中，要尊重历史事实，结合实际情况制定合理的处理方案。
保护合法权益：在处理历史遗留违法用地时，要保护相关当事人的合法权益，避免因处理不当而引发纠纷。
综上所述，历史遗留问题的违法用地处理需要遵循相关政策规定和法律法规，结合实际情况制定合理的处理方案。如果您所在地区有具体的处理政策或规定，建议您详细咨询当地相关部门或专业人士以获取更准确的信息。