企业违法用地是一个严肃的法律问题，一旦查实，将面临一系列严厉的法律制裁。以下是对企业违法用地处理的详细解析：
一、违法用地的认定
首先，需要明确什么是违法用地。违法用地通常指的是单位或个人未经批准擅自占用土地、采取欺骗手段骗取批准占用土地，或超过批准数量多占土地等行为。这些行为都严重违反了土地管理法规，损害了土地资源的合理利用和社会公共利益。
二、行政处理措施
责令退还非法占用土地：
- 县级以上人民政府自然资源主管部门有权要求企业退还非法占用的土地。企业若需使用土地进行建设，必须依法申请国有土地使用权。
限期拆除与恢复原状：
- 如果企业违反土地利用总体规划，擅自将农用地改为建设用地，相关部门将责令限期拆除在非法土地上新建的建筑物及其他设施，并恢复土地原状。
没收非法建筑：
- 若企业的非法占地行为符合土地利用总体规划，但未经批准，则新建的建筑物和其他设施将被没收。
罚款：
- 企业可能面临每平方米100元至1000元的罚款，具体金额根据违法情节的严重程度确定。
行政处分：
- 对违法用地企业的直接负责人员和其他责任人员，将依法给予行政处分，包括警告、记过、降级、撤职等。
三、刑事处罚规定
非法占用农用地罪：
- 根据《中华人民共和国刑法》第三百四十二条，企业非法占用耕地、林地等农用地，改变用途且数量较大，造成毁坏的，相关责任人员可处五年以下有期徒刑或拘役，并处罚金。
非法转让、倒卖土地使用权罪：
- 如果企业以牟利为目的，非法转让、倒卖土地使用权，情节严重的，将面临三年以下有期徒刑或拘役，并处或者单处罚金。情节特别严重者，刑罚更重。
非法批准征收、征用、占用土地罪：
- 如果企业涉及国家机关工作人员滥用职权，非法批准征收、征用、占用土地，或低价出让国有土地使用权的，相关责任人员将受到法律的严惩。
四、民事赔偿责任
- 因企业违法用地给他人造成损失的，企业需承担民事赔偿责任，包括但不限于农作物的预期收益、土地改良费用等。
五、处理程序与权益保护
调查取证：
- 在发现企业违法用地行为后，自然资源主管部门将进行调查取证，收集相关证据材料。
作出处理决定：
- 根据调查结果和相关法律法规，自然资源主管部门将作出处理决定，包括责令退还土地、限期拆除或没收建筑物、罚款等。
陈述与申辩：
- 在行政处罚前，企业享有陈述、申辩的权利，并可提出异议。
行政复议与行政诉讼：
- 如企业对行政处罚决定不服，可依法申请行政复议或提起行政诉讼，以维护自身合法权益。
六、建议与预防措施
合法用地：
- 企业应通过合法途径申请使用土地，严格遵守土地管理法规，确保用地行为的合法性。
及时整改：
- 一旦发现违法占地行为，企业应立即停止并配合调查，主动采取措施进行整改。
咨询律师：
- 在面临土地问题时，企业应咨询专业律师，了解相关法律法规，寻求合法解决方案。
加强内部管理：
- 企业应加强内部管理，提高法律意识，确保经营活动的合法性，避免违法用地行为的发生。
综上所述，企业违法用地将面临严厉的法律制裁。因此，企业必须高度重视土地使用的合法性，严格遵守土地管理法规，确保经营活动的合法性和可持续性。