结论：员工在特定情况下可以因公司休年假不算出勤、扣加班天数的行为而解除劳动合同，并可能要求公司支付经济补偿金，但需根据具体情况判断。
分析：
年假与出勤的关系：
- 根据《职工带薪年休假条例》，职工在年休假期间享受与正常工作期间相同的工资收入。这意味着，年假应被视为出勤，公司不应因此扣除员工的工资或加班天数。
- 如果公司政策或实践与法律规定相悖，即休年假不算出勤并扣除加班天数，这可能构成违法行为。
员工解除劳动合同的权利：
- 根据《劳动合同法》，如果公司未按照劳动合同约定提供劳动保护或者劳动条件，包括未依法支付劳动报酬（如年假工资），员工有权解除劳动合同。
- 在此情况下，员工不仅可以解除劳动合同，还可能根据《劳动合同法》的规定要求公司支付经济补偿金。
具体操作与证据收集：
- 员工在决定解除劳动合同前，应确保收集足够的证据来证明公司的违法行为，如公司政策文件、工资单、考勤记录等。
- 员工应先与公司进行沟通，尝试通过协商解决问题。如果协商无果，员工可以向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁。
可能的法律后果：
- 如果员工能够证明公司因休年假不算出勤而扣除加班天数的行为违法，并且因此决定解除劳动合同，员工有权要求公司支付经济补偿金。
- 经济补偿金的具体数额将根据员工在公司的工作年限、工资水平等因素确定。
建议与注意事项：
- 在采取任何行动之前，员工应仔细研究相关法律法规，并确保自己的行为符合法律要求。
- 员工也可以考虑咨询专业律师（比如我）以获取更具体的法律建议和指导。
- 在整个过程中，员工应保持冷静和理性，避免采取过激行为。
举例：
假设某员工在公司工作多年，每年都依法享受年假。但今年，公司突然改变政策，规定休年假不算出勤，并要扣除相应的加班天数。员工认为这违反了法律规定，并决定与公司沟通。沟通无果后，员工收集了相关证据，包括公司政策文件、工资单等，并向劳动监察部门投诉。最终，员工成功维护了自己的合法权益，并获得了相应的经济补偿金。
总结：
员工在面对公司休年假不算出勤、扣加班天数的行为时，有权根据法律规定解除劳动合同并要求经济补偿金。但在此之前，员工应确保收集足够的证据，并仔细研究相关法律法规。如果有任何疑问或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。